معرفی شرکت ها

jellyfish_2.2.8-3build1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

count k-mers in DNA sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته jellyfish
نام فایل بسته jellyfish_2.2.8-3build1_amd64.deb
نسخه بسته 2.2.8
انتشار بسته 3build1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.cbcb.umd.edu/software/jellyfish/
مجوز -
حجم دانلود 357708
حجم نصب 606
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism. . JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
jellyfish-examples_2.2.8-3build1_amd64.deb 2.2.8 amd64 Ubuntu universe
jellyfish1_1.1.11-3_amd64.deb 1.1.11 amd64 Ubuntu universe
jellyfish1_1.1.11-3_i386.deb 1.1.11 i386 Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6
>= 1:3.0 libgcc1
= 2.2.8-3build1 libjellyfish-2.0-2
>= 5.2 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb jellyfish:

    sudo apt-get install jellyfish_2.2.8-3build1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/jellyfish
./usr/share/doc/jellyfish/README.test
./usr/share/doc/jellyfish/copyright
./usr/share/doc/jellyfish/jellyfish.pdf.gz
./usr/share/doc/jellyfish/run-unit-test
./usr/share/doc-base/jellyfish
./usr/share/man/man1/jellyfish.1.gz
./usr/share/doc/jellyfish/changelog.Debian.gz -> ../libjellyfish-2.0-2/changelog.Debian.gz