معرفی شرکت ها

mmseq-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Haplotype and isoform specific expression estimation for RNA-seq
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Fedora 39
مخزن Fedora Everything x86_64
نام بسته mmseq
نام فایل بسته mmseq-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm
نسخه بسته 1.0.11
انتشار بسته 16.fc39
معماری بسته x86_64
نگهدارنده -
تاریخ ساخت Thu 20 Jul 2023 07
هاست سازنده buildhw-x86-11.iad2.fedoraproject.org
نوع بسته .rpm
آدرس صفحه اصلی https://github.com/eturro/mmseq
مجوز GPLv2+
حجم دانلود 772K
حجم نصب 1.781M
Software for fast, scalable haplotype and isoform expression estimation using multi-mapping RNA-seq reads. Example scripts are included.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
mmseq-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm 1.0.11 aarch64 Fedora Everything
mmseq-1.0.11-16.fc39.src.rpm 1.0.11 i686 Fedora Everything
mmseq-debuginfo-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm 1.0.11 aarch64 Fedora Everything
mmseq-debuginfo-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm 1.0.11 x86_64 Fedora Everything
mmseq-debugsource-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm 1.0.11 aarch64 Fedora Everything
mmseq-debugsource-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm 1.0.11 x86_64 Fedora Everything


نیازمندی

مقدار نام
- /usr/bin/bash
- /usr/bin/perl
- /usr/bin/ruby
- /usr/bin/sh
>= 2.37.9000-17 glibc
- libboost_iostreams.so.1.81.0()(64bit)
- libboost_regex.so.1.81.0()(64bit)
- libc.so.6()(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.14)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.3)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.3.4)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.32)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.33)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.34)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.38)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.4)(64bit)
- libflexiblas.so.3()(64bit)
- libgcc_s.so.1()(64bit)
- libgcc_s.so.1(GCC_3.0)(64bit)
- libgcc_s.so.1(GCC_3.3.1)(64bit)
- libgomp.so.1()(64bit)
- libgomp.so.1(GOMP_1.0)(64bit)
- libgomp.so.1(GOMP_4.0)(64bit)
- libgomp.so.1(OMP_1.0)(64bit)
- libgsl.so.27()(64bit)
- libgslcblas.so.0()(64bit)
- libhts.so.3()(64bit)
- libm.so.6()(64bit)
- libm.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)
- libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)
- libstdc++.so.6()(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3)(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.8)(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.9)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.11)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.15)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.20)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.21)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.26)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.29)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.30)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.32)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.9)(64bit)
- perl(strict)
- perl-interpreter
- rtld(GNU_HASH)
- ruby
- samtools


ارائه دهنده

مقدار نام
= 1.0.11-16.fc39 mmseq
= 1.0.11-16.fc39 mmseq(x86-64)


نحوه نصب


نصب پکیج rpm mmseq:

    dnf install mmseq-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm


فایل ها

مسیرها
/usr/bin/bam2hits
/usr/bin/ensembl_gtf_to_gff.pl
/usr/bin/extract_transcripts
/usr/bin/fastagrep.sh
/usr/bin/filterGTF.rb
/usr/bin/haploref.rb
/usr/bin/hitstools
/usr/bin/mmcollapse
/usr/bin/mmdiff
/usr/bin/mmseq
/usr/bin/mouse_strain_transcriptome.sh
/usr/bin/offsetGTF
/usr/bin/t2g_hits
/usr/bin/testregexp.rb
/usr/bin/usage.sh
/usr/lib/.build-id
/usr/lib/.build-id/13
/usr/lib/.build-id/13/1b2a1376946ceb195c429b06027ba55e25eeb3
/usr/lib/.build-id/5a
/usr/lib/.build-id/5a/7dae416346fe7bde4151311ea4417ddd21b5f2
/usr/lib/.build-id/5f
/usr/lib/.build-id/5f/1220bf869067bebdf55a5f8c7056684c8e3db9
/usr/lib/.build-id/7f
/usr/lib/.build-id/7f/a1aafed01178ca86659447eee1d6bc2e1e0a6d
/usr/lib/.build-id/8c
/usr/lib/.build-id/8c/61b631916da5171aa783bb77f91e169f3ea838
/usr/lib/.build-id/c1
/usr/lib/.build-id/c1/c5104069788f4e16bcb9d231113081b35118dc
/usr/lib/.build-id/dc
/usr/lib/.build-id/dc/f282e49239ed056b9362861a8ecb59ab03d67e
/usr/lib/.build-id/e3
/usr/lib/.build-id/e3/c5633d9912e68015581c5d41b331a9ed84d525
/usr/share/doc/mmseq
/usr/share/doc/mmseq/COPYING
/usr/share/doc/mmseq/README.md
/usr/share/doc/mmseq/doc
/usr/share/doc/mmseq/doc/332.mat
/usr/share/doc/mmseq/doc/countsDE.md
/usr/share/doc/mmseq/doc/dod2.mat
/usr/share/doc/mmseq/doc/mmdiff-model.png


گزارش تغییرات

تاریخ آخرین تغییر جزئیات
2023-07-20

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_39_Mass_Rebuild

2023-02-20

Rebuilt for Boost 1.81

2023-01-19

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_38_Mass_Rebuild

2022-08-23

Rebuild for gsl-2.7.1

2022-07-21

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_37_Mass_Rebuild

2022-05-04

Rebuilt for Boost 1.78

2022-01-20

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_36_Mass_Rebuild

2021-08-07

Rebuilt for Boost 1.76

2021-07-22

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_35_Mass_Rebuild