معرفی شرکت ها

mmseq-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Haplotype and isoform specific expression estimation for RNA-seq
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Fedora 39
مخزن Fedora Everything aarch64
نام بسته mmseq
نام فایل بسته mmseq-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm
نسخه بسته 1.0.11
انتشار بسته 16.fc39
معماری بسته aarch64
نگهدارنده -
تاریخ ساخت Thu 20 Jul 2023 07
هاست سازنده buildvm-a64-14.iad2.fedoraproject.org
نوع بسته .rpm
آدرس صفحه اصلی https://github.com/eturro/mmseq
مجوز GPLv2+
حجم دانلود 729K
حجم نصب 2.645M
Software for fast, scalable haplotype and isoform expression estimation using multi-mapping RNA-seq reads. Example scripts are included.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
mmseq-1.0.11-16.fc39.src.rpm 1.0.11 i686 Fedora Everything
mmseq-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm 1.0.11 x86_64 Fedora Everything
mmseq-debuginfo-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm 1.0.11 aarch64 Fedora Everything
mmseq-debuginfo-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm 1.0.11 x86_64 Fedora Everything
mmseq-debugsource-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm 1.0.11 aarch64 Fedora Everything
mmseq-debugsource-1.0.11-16.fc39.x86_64.rpm 1.0.11 x86_64 Fedora Everything


نیازمندی

مقدار نام
- /usr/bin/bash
- /usr/bin/perl
- /usr/bin/ruby
- /usr/bin/sh
>= 2.37.9000-17 glibc
- ld-linux-aarch64.so.1()(64bit)
- ld-linux-aarch64.so.1(GLIBC_2.17)(64bit)
- libboost_iostreams.so.1.81.0()(64bit)
- libboost_regex.so.1.81.0()(64bit)
- libc.so.6()(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.17)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.32)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.33)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.34)(64bit)
- libc.so.6(GLIBC_2.38)(64bit)
- libflexiblas.so.3()(64bit)
- libgcc_s.so.1()(64bit)
- libgcc_s.so.1(GCC_3.0)(64bit)
- libgcc_s.so.1(GCC_3.3.1)(64bit)
- libgomp.so.1()(64bit)
- libgomp.so.1(GOMP_1.0)(64bit)
- libgomp.so.1(GOMP_4.0)(64bit)
- libgomp.so.1(OMP_1.0)(64bit)
- libgsl.so.27()(64bit)
- libgslcblas.so.0()(64bit)
- libhts.so.3()(64bit)
- libm.so.6()(64bit)
- libm.so.6(GLIBC_2.17)(64bit)
- libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)
- libstdc++.so.6()(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3)(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.8)(64bit)
- libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.9)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.11)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.15)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.20)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.21)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.26)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.29)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.30)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.32)(64bit)
- libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.9)(64bit)
- perl(strict)
- perl-interpreter
- rtld(GNU_HASH)
- ruby
- samtools


ارائه دهنده

مقدار نام
= 1.0.11-16.fc39 mmseq
= 1.0.11-16.fc39 mmseq(aarch-64)


نحوه نصب


نصب پکیج rpm mmseq:

    dnf install mmseq-1.0.11-16.fc39.aarch64.rpm


فایل ها

مسیرها
/usr/bin/bam2hits
/usr/bin/ensembl_gtf_to_gff.pl
/usr/bin/extract_transcripts
/usr/bin/fastagrep.sh
/usr/bin/filterGTF.rb
/usr/bin/haploref.rb
/usr/bin/hitstools
/usr/bin/mmcollapse
/usr/bin/mmdiff
/usr/bin/mmseq
/usr/bin/mouse_strain_transcriptome.sh
/usr/bin/offsetGTF
/usr/bin/t2g_hits
/usr/bin/testregexp.rb
/usr/bin/usage.sh
/usr/lib/.build-id
/usr/lib/.build-id/43
/usr/lib/.build-id/43/111efcc1ef32393907663283fd763ff449fd78
/usr/lib/.build-id/4a
/usr/lib/.build-id/4a/d437be6b407ca10ec389af67be9614c607cdfa
/usr/lib/.build-id/83
/usr/lib/.build-id/83/416d0d9efa500e86c391c931311afd6dfe788c
/usr/lib/.build-id/85
/usr/lib/.build-id/85/18ca357885cad7e72e757e6878f9c10d46771c
/usr/lib/.build-id/9f
/usr/lib/.build-id/9f/06cd92734b4d4e40582826f6ced22f3506be4c
/usr/lib/.build-id/a9
/usr/lib/.build-id/a9/3c7f436fad355749d99db4e210538b51a9ac41
/usr/lib/.build-id/bc
/usr/lib/.build-id/bc/0f53146d51d78e43094e4ecf95383d44abb410
/usr/lib/.build-id/d7
/usr/lib/.build-id/d7/fcc7c259f41383137bc5fbe88b425d201659f4
/usr/share/doc/mmseq
/usr/share/doc/mmseq/COPYING
/usr/share/doc/mmseq/README.md
/usr/share/doc/mmseq/doc
/usr/share/doc/mmseq/doc/332.mat
/usr/share/doc/mmseq/doc/countsDE.md
/usr/share/doc/mmseq/doc/dod2.mat
/usr/share/doc/mmseq/doc/mmdiff-model.png


گزارش تغییرات

تاریخ آخرین تغییر جزئیات
2023-07-20

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_39_Mass_Rebuild

2023-02-20

Rebuilt for Boost 1.81

2023-01-19

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_38_Mass_Rebuild

2022-08-23

Rebuild for gsl-2.7.1

2022-07-21

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_37_Mass_Rebuild

2022-05-04

Rebuilt for Boost 1.78

2022-01-20

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_36_Mass_Rebuild

2021-08-07

Rebuilt for Boost 1.76

2021-07-22

Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_35_Mass_Rebuild