معرفی شرکت ها

mindthegap_2.2.2-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

performs detection and assembly of DNA insertion variants in NGS read datasets
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Debian Bullseye-11
مخزن Debian main amd64
نام بسته mindthegap
نام فایل بسته mindthegap_2.2.2-2_amd64.deb
نسخه بسته 2.2.2
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/GATB/MindTheGap
مجوز -
حجم دانلود 232968
حجم نصب 1004
Designed to call insertions of any size, whether they are novel or duplicated, homozygous or heterozygous in the donor genome. It takes as input a set of reads and a reference genome. It outputs two sets of FASTA sequences: one is the set of breakpoints of detection insertion sites, the other is the set of assembled insertions for each breakpoint. MindTheGap can also be used as a genome assembly finishing tool. It can fill the gaps between a set of input contigs without any a priori on their relative order and orientation. It outputs the results in gfa file.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
mindthegap-examples_2.2.2-2_all.deb 2.2.2 all Debian main
mindthegap_2.2.2-2_arm64.deb 2.2.2 arm64 Debian main
mindthegap_2.2.2-2_i386.deb 2.2.2 i386 Debian main
mindthegap_2.2.2-2_mips64el.deb 2.2.2 mips64el Debian main
mindthegap_2.2.2-2_ppc64el.deb 2.2.2 ppc64el Debian main
mindthegap_2.2.2-2_s390x.deb 2.2.2 s390x Debian main


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6
>= 1.4.2+dfsg libgatbcore3
>= 3.0 libgcc-s1
- libhdf5-103-1
>= 9 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb mindthegap:

    sudo apt-get install mindthegap_2.2.2-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/MindTheGap
./usr/share/doc/mindthegap/README.md.gz
./usr/share/doc/mindthegap/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/mindthegap/changelog.gz
./usr/share/doc/mindthegap/copyright
./usr/share/man/man1/MindTheGap.1.gz