معرفی شرکت ها
libbio-db-gff-perl_1.7.4-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Storage and retrieval of sequence annotation data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Mantic-23.10 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | libbio-db-gff-perl |
| نام فایل بسته | libbio-db-gff-perl_1.7.4-1_all.deb |
| نسخه بسته | 1.7.4 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://metacpan.org/release/Bio-DB-GFF |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 272888 |
| حجم نصب | 854 |
Bio::DB::GFF provides fast indexed access to a sequence annotation database.
It supports multiple database types (ACeDB, relational), and multiple schemas
through a system of adaptors and aggregators.
.
The following operations are supported by this module:
.
- retrieving a segment of sequence based on the ID of a landmark
.
- retrieving the DNA from that segment
.
- finding all annotations that overlap with the segment
.
- finding all annotations that are completely contained within the
segment
.
- retrieving all annotations of a particular type, either within a
segment, or globally
.
- conversion from absolute to relative coordinates and back again,
using any arbitrary landmark for the relative coordinates
.
- using a sequence segment to create new segments based on relative
offsets
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | perl:any |
| - | libapache-dbi-perl |
| - | libbio-perl-perl |
| - | libbio-db-biofetch-perl |
| - | libcgi-pm-perl |
نحوه نصب
نصب پکیج deb libbio-db-gff-perl:
sudo apt-get install libbio-db-gff-perl_1.7.4-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/bp_bulk_load_gff |
| ./usr/bin/bp_das_server |
| ./usr/bin/bp_fast_load_gff |
| ./usr/bin/bp_genbank2gff |
| ./usr/bin/bp_generate_histogram |
| ./usr/bin/bp_load_gff |
| ./usr/bin/bp_meta_gff |
| ./usr/share/doc/libbio-db-gff-perl/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/libbio-db-gff-perl/copyright |
| ./usr/share/man/man1/bp_bulk_load_gff.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/bp_fast_load_gff.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/bp_genbank2gff.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/bp_generate_histogram.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/bp_load_gff.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/bp_meta_gff.1p.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb::iterator.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch_oracle.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::caching_handle.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::iterator.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysql.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlcmap.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlopt.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::oracle.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::pg.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::pg_fts.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::memory.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::memory::feature_serializer.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Adaptor::memory::iterator.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::alignment.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::clone.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::coding.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::gene.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::match.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::none.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::orf.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::processed_transcript.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::so_transcript.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::transcript.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_acembly.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_ensgene.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_genscan.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_refgene.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_sanger22pseudo.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::DB::GFF::Aggregator::ucsc_softberry.3pm.gz |
| ... and 52 more |