معرفی شرکت ها
bio-tradis_1.4.5+dfsg2-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
analyse the output from TraDIS analyses of genomic sequences
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Mantic-23.10 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | bio-tradis |
| نام فایل بسته | bio-tradis_1.4.5+dfsg2-1_all.deb |
| نسخه بسته | 1.4.5+dfsg2 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/sanger-pathogens/Bio-Tradis |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 84016 |
| حجم نصب | 242 |
Bio-Tradis contains a set of tools to analyse the output from
TraDIS analyses.
.
The Bio-Tradis analysis pipeline is implemented as an extensible Perl
library which can either be used as is, or as a basis for the
development of more advanced analysis tools.
.
Please note: You need to manually install BioConductor Edger which can
not be distributed by Debian in recent version since it is using
non-distributable code locfit.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | perl:any |
| - | libbio-perl-perl |
| - | libexception-class-perl |
| - | libmoose-perl |
| - | libtext-csv-perl |
| - | libtry-tiny-perl |
| - | smalt |
| - | samtools |
| - | tabix |
| - | r-base-core |
| - | r-cran-getopt |
| - | r-cran-mass |
نحوه نصب
نصب پکیج deb bio-tradis:
sudo apt-get install bio-tradis_1.4.5+dfsg2-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/add_tradis_tags |
| ./usr/bin/bacteria_tradis |
| ./usr/bin/check_tradis_tags |
| ./usr/bin/combine_tradis_plots |
| ./usr/bin/filter_tradis_tags |
| ./usr/bin/remove_tradis_tags |
| ./usr/bin/tradis_comparison |
| ./usr/bin/tradis_essentiality |
| ./usr/bin/tradis_gene_insert_sites |
| ./usr/bin/tradis_merge_plots |
| ./usr/bin/tradis_plot |
| ./usr/share/doc/bio-tradis/NEWS.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/bio-tradis/README.Debian |
| ./usr/share/doc/bio-tradis/README.md.gz |
| ./usr/share/doc/bio-tradis/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/bio-tradis/copyright |
| ./usr/share/man/man1/add_tradis_tags.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/bacteria_tradis.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/check_tradis_tags.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/combine_tradis_plots.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/filter_tradis_tags.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/remove_tradis_tags.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/tradis_comparison.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/tradis_essentiality.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/tradis_gene_insert_sites.1p.gz |
| ./usr/share/man/man1/tradis_merge_plots.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/tradis_plot.1p.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::AddTagsToSeq.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Analysis::Exceptions.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Analysis::InsertSite.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CombinePlots.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::AddTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::CheckTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::FilterFastqTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::PlotCombine.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::PlotTradis.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::RemoveFastqTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::RunMapping.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::TradisAnalysis.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::CommandLine::TradisBam.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::DetectTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Exception.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::FilterTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Map.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Parser::Bam.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Parser::Cigar.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::Parser::Fastq.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::RemoveTags.3pm.gz |
| ./usr/share/man/man3/Bio::Tradis::RunTradis.3pm.gz |
| ... and 28 more |