معرفی شرکت ها
progressivemauve_1.2.0+4713+dfsg-5build1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
multiple genome alignment algorithms
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Lunar-23.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | progressivemauve |
| نام فایل بسته | progressivemauve_1.2.0+4713+dfsg-5build1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.2.0+4713+dfsg |
| انتشار بسته | 5build1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://darlinglab.org/mauve/user-guide/mauvealigner.html |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 869288 |
| حجم نصب | 5673 |
The mauveAligner and progressiveMauve alignment algorithms have been
implemented as command-line programs included with the downloadable Mauve
software. When run from the command-line, these programs provide options
not yet available in the graphical interface.
.
Mauve is a system for efficiently constructing multiple genome alignments
in the presence of large-scale evolutionary events such as rearrangement
and inversion. Multiple genome alignment provides a basis for research
into comparative genomics and the study of evolutionary dynamics. Aligning
whole genomes is a fundamentally different problem than aligning short
sequences.
.
Mauve has been developed with the idea that a multiple genome aligner
should require only modest computational resources. It employs algorithmic
techniques that scale well in the amount of sequence being aligned. For
example, a pair of Y. pestis genomes can be aligned in under a minute,
while a group of 9 divergent Enterobacterial genomes can be aligned in
a few hours.
.
Mauve computes and interactively visualizes genome sequence comparisons.
Using FastA or GenBank sequence data, Mauve constructs multiple genome
alignments that identify large-scale rearrangement, gene gain, gene loss,
indels, and nucleotide substutition.
.
Mauve is developed at the University of Wisconsin.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 1.74.0 | libboost-filesystem1.74.0 |
| >= 1.74.0 | libboost-iostreams1.74.0 |
| >= 1.74.0 | libboost-program-options1.74.0 |
| >= 2.29 | libc6 |
| >= 3.4 | libgcc-s1 |
| >= 1.3.11+svn20110227.4616 | libgenome0 |
| >= 1.6.0+4725 | libmems1 |
| >= 9 | libstdc++6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb progressivemauve:
sudo apt-get install progressivemauve_1.2.0+4713+dfsg-5build1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/addUnalignedIntervals |
| ./usr/bin/alignmentProjector |
| ./usr/bin/backbone_global_to_local |
| ./usr/bin/bbAnalyze |
| ./usr/bin/bbFilter |
| ./usr/bin/coordinateTranslate |
| ./usr/bin/createBackboneMFA |
| ./usr/bin/extractBCITrees |
| ./usr/bin/getAlignmentWindows |
| ./usr/bin/getOrthologList |
| ./usr/bin/makeBadgerMatrix |
| ./usr/bin/mauveAligner |
| ./usr/bin/mauveToXMFA |
| ./usr/bin/mfa2xmfa |
| ./usr/bin/progressiveMauve |
| ./usr/bin/projectAndStrip |
| ./usr/bin/randomGeneSample |
| ./usr/bin/repeatoire |
| ./usr/bin/scoreAlignment |
| ./usr/bin/stripGapColumns |
| ./usr/bin/stripSubsetLCBs |
| ./usr/bin/toGrimmFormat |
| ./usr/bin/toMultiFastA |
| ./usr/bin/toRawSequence |
| ./usr/bin/uniqueMerCount |
| ./usr/bin/uniquifyTrees |
| ./usr/bin/xmfa2maf |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/README.test |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/copyright |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/run-unit-test |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/test_data/all_virii.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/test_data/genome_1.gbk.gz |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/test_data/genome_2.gbk.gz |
| ./usr/share/doc/progressivemauve/test_data/genome_3.gbk.gz |
| ./usr/share/man/man1/addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/bbFilter.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/coordinateTranslate.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/extractBCITrees.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/mauveAligner.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/progressiveMauve.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/repeatoire.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/alignmentProjector.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/backbone_global_to_local.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/bbAnalyze.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/createBackboneMFA.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/getAlignmentWindows.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/getOrthologList.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/makeBadgerMatrix.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ./usr/share/man/man1/mauveToXMFA.1.gz -> addUnalignedIntervals.1.gz |
| ... and 13 more |