معرفی شرکت ها


sift_4.0.3b-6_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Lunar-23.04
مخزن Ubuntu multiverse amd64
نام بسته sift
نام فایل بسته sift_4.0.3b-6_amd64.deb
نسخه بسته 4.0.3b
انتشار بسته 6
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://sift.bii.a-star.edu.sg/
مجوز -
حجم دانلود 253272
حجم نصب 1000
SIFT is a sequence homology-based tool that sorts intolerant from tolerant amino acid substitutions and predicts whether an amino acid substitution in a protein will have a phenotypic effect. SIFT is based on the premise that protein evolution is correlated with protein function. Positions important for function should be conserved in an alignment of the protein family, whereas unimportant positions should appear diverse in an alignment.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
siftool_2.8.3-1_amd64.deb 2.8.3 amd64 Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
- libblimps3
>= 2.23 libc6
- blimps-utils
- csh


نحوه نصب


نصب پکیج deb sift:

    sudo apt-get install sift_4.0.3b-6_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/sift/bin/Classify_SNPs_Indels.pl
./usr/lib/sift/bin/DNA_PROT_SUBROUTINES.pl
./usr/lib/sift/bin/IntersectLocations.sh
./usr/lib/sift/bin/SIFT_exome_indels.pl
./usr/lib/sift/bin/SIFT_exome_nssnvs.pl
./usr/lib/sift/bin/SIFT_for_submitting_NCBI_gi_id.csh
./usr/lib/sift/bin/SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh
./usr/lib/sift/bin/SIFT_intersect_cds.pl
./usr/lib/sift/bin/SIFT_subroutines.pm
./usr/lib/sift/bin/SNPClassifier/Classify_SNPs.pl
./usr/lib/sift/bin/SNPClassifier/Extract_Coding_Info.pl
./usr/lib/sift/bin/choose_seqs_via_psiblastseedmedian
./usr/lib/sift/bin/clump_output_alignedseq
./usr/lib/sift/bin/consensus_to_seq
./usr/lib/sift/bin/detect_indel.pl
./usr/lib/sift/bin/detect_repeat.pl
./usr/lib/sift/bin/get_sequences.pl
./usr/lib/sift/bin/indelfile_to_gff.pl
./usr/lib/sift/bin/info_on_seqs
./usr/lib/sift/bin/map_coords_to_bin.pl
./usr/lib/sift/bin/map_coords_to_bin_indels.pl
./usr/lib/sift/bin/model_transcript.pl
./usr/lib/sift/bin/perlscripts/get_BLINK_seq.pl
./usr/lib/sift/bin/perlscripts/separate_query_from_rest_of_seqs.pl
./usr/lib/sift/bin/psiblast_res_to_fasta_dbpairwise
./usr/lib/sift/bin/reformat_chrfile.pl
./usr/lib/sift/bin/seqs_chosen_via_median_info.csh
./usr/lib/sift/bin/seqs_from_psiblast_res
./usr/lib/sift/bin/seqs_to_matrixweb
./usr/lib/sift/bin/sift_feed_to_chr_coords_batch.pl
./usr/lib/sift/bin/snv_db_engine.pl
./usr/share/doc/sift/README.Debian
./usr/share/doc/sift/README.gz
./usr/share/doc/sift/README_4.0.3.gz
./usr/share/doc/sift/VERSION_UPDATE
./usr/share/doc/sift/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/sift/copyright
./usr/share/doc/sift/examples/lacI.SIFTprediction
./usr/share/doc/sift/examples/lacI.alignedfasta
./usr/share/doc/sift/examples/lacI.fasta
./usr/share/doc/sift/examples/lacI.fasta.query.out.gz
./usr/share/doc/sift/examples/lacI.subst
./usr/share/man/man1/SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh.1.gz
./usr/share/man/man1/info_on_seqs.1.gz
./usr/share/sift/IntersectFeatures.jar
./usr/share/sift/blimps/docs/blosum62.bla.new
./usr/share/sift/blimps/docs/coduse.csh
./usr/share/sift/blimps/docs/config.doc
./usr/share/sift/blimps/docs/default.amino.frq
./usr/share/sift/blimps/docs/default.codon.frq
... and 23 more