معرفی شرکت ها

r-cran-spp_1.16.0-2_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

GNU R ChIP-seq processing pipeline
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Jammy-22.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته r-cran-spp
نام فایل بسته r-cran-spp_1.16.0-2_amd64.deb
نسخه بسته 1.16.0
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://cran.r-project.org/package=spp
مجوز -
حجم دانلود 322968
حجم نصب 456
R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data * Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate quality of tag alignment. * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags. * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them in WIG files for viewing in other browsers. * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of significant enrichment/depletion. * Determine statistically significant point binding positions * Assess whether the set of point binding positions detected at a current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not, estimate what sequencing depth would be required to do so.


نیازمندی

مقدار نام
>= 4.0.2-1build1 r-base-core
- r-api-4.0
- r-cran-rcpp
- r-bioc-rsamtools
- r-cran-catools
>= 1.66 r-cran-bh
- libbz2-1.0
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 5.2 libstdc++6
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-cran-spp:

    sudo apt-get install r-cran-spp_1.16.0-2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/spp/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/spp/INDEX
./usr/lib/R/site-library/spp/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/spp/R/spp
./usr/lib/R/site-library/spp/R/spp.rdb
./usr/lib/R/site-library/spp/R/spp.rdx
./usr/lib/R/site-library/spp/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/spp/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/spp/help/spp.rdb
./usr/lib/R/site-library/spp/help/spp.rdx
./usr/lib/R/site-library/spp/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/spp/html/R.css
./usr/lib/R/site-library/spp/libs/spp.so
./usr/share/doc/r-cran-spp/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/r-cran-spp/copyright