معرفی شرکت ها

alien-hunter_1.7-8_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Interpolated Variable Order Motifs to identify horizontally acquired DNA
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Jammy-22.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته alien-hunter
نام فایل بسته alien-hunter_1.7-8_all.deb
نسخه بسته 1.7
انتشار بسته 8
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.sanger.ac.uk/science/tools/alien-hunter
مجوز -
حجم دانلود 28320
حجم نصب 112
Alien_hunter is an application for the prediction of putative Horizontal Gene Transfer (HGT) events with the implementation of Interpolated Variable Order Motifs (IVOMs). An IVOM approach exploits compositional biases using variable order motif distributions and captures more reliably the local composition of a sequence compared to fixed-order methods. Optionally the predictions can be parsed into a 2-state 2nd order Hidden Markov Model (HMM), in a change-point detection framework, to optimize the localization of the boundaries of the predicted regions. The predictions (embl format) can be automatically loaded into Artemis genome viewer freely available at: http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/.


نیازمندی

مقدار نام
- libbytecode-java
- libbiojava-java
- libcommons-cli-java
- libcommons-collections3-java
- libcommons-dbcp-java
- libcommons-pool-java


نحوه نصب


نصب پکیج deb alien-hunter:

    sudo apt-get install alien-hunter_1.7-8_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/alien_hunter
./usr/share/alien_hunter/ChangepointLeft$1.class
./usr/share/alien_hunter/ChangepointLeft.class
./usr/share/alien_hunter/ChangepointRight$1.class
./usr/share/alien_hunter/ChangepointRight.class
./usr/share/alien_hunter/alien_hunter.pl
./usr/share/doc/alien-hunter/README.test
./usr/share/doc/alien-hunter/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/alien-hunter/copyright
./usr/share/doc/alien-hunter/examples/demoSeq.dna
./usr/share/doc/alien-hunter/run-unit-test
./usr/share/man/man1/alien_hunter.1.gz
./usr/share/perl5/PAI_scripts/CutOff.pm
./usr/share/perl5/PAI_scripts/MotifMaker.pm
./usr/share/perl5/PAI_scripts/changePoint.pm
./usr/share/perl5/PAI_scripts/help.pm
./usr/share/perl5/PAI_scripts/overlap.pm
./usr/share/perl5/PAI_scripts/rrna.pm
./usr/share/perl5/changepointCaller.pm