معرفی شرکت ها
topp_2.4.0-real-1ubuntu4_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Focal-20.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | topp |
| نام فایل بسته | topp_2.4.0-real-1ubuntu4_amd64.deb |
| نسخه بسته | 2.4.0 |
| انتشار بسته | real |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://www.openms.de |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 2766528 |
| حجم نصب | 16117 |
TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis
of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications
that can be chained together to create analysis pipelines tailored
for a specific problem. The applications make use of the libopenms
library. Some examples of these applications are :
.
- TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
- TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
- DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
files in DTA format.
- FileConverter: Converts between different MS file formats.
- FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
feature or consensus feature files.
- SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
precursor or by RT blocks.
- BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
top-hat filter.
- InternalCalibration: Applies an internal calibration.
- PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
peptides from a training set.
- RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
trained by RTModel.
- ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| toppler_1.1.6-3build1_amd64.deb | 1.1.6 | amd64 | Ubuntu universe |
| toppred_1.10-7_amd64.deb | 1.10 | amd64 | Ubuntu universe |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | libboost-regex1.71.0-icu66 |
| >= 2.29 | libc6 |
| >= 3.0 | libgcc-s1 |
| >= 6 | libgomp1 |
| = 2.4.0-real-1ubuntu4 | libopenms2.4.0 |
| >= 5.12.2 | libqt5core5a |
| >= 5.8.0 | libqt5gui5 (>= 5.8.0) | libqt5gui5-gles |
| >= 5.7.0 | libqt5widgets5 |
| >= 9 | libstdc++6 |
| - | libxerces-c3.2 |
| = 2.4.0-real-1ubuntu4 | openms-common |
نحوه نصب
نصب پکیج deb topp:
sudo apt-get install topp_2.4.0-real-1ubuntu4_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/AccurateMassSearch |
| ./usr/bin/AssayGeneratorMetabo |
| ./usr/bin/BaselineFilter |
| ./usr/bin/CVInspector |
| ./usr/bin/ClusterMassTraces |
| ./usr/bin/ClusterMassTracesByPrecursor |
| ./usr/bin/CometAdapter |
| ./usr/bin/CompNovo |
| ./usr/bin/CompNovoCID |
| ./usr/bin/ConsensusID |
| ./usr/bin/ConsensusMapNormalizer |
| ./usr/bin/CruxAdapter |
| ./usr/bin/DTAExtractor |
| ./usr/bin/DatabaseFilter |
| ./usr/bin/DeMeanderize |
| ./usr/bin/Decharger |
| ./usr/bin/DecoyDatabase |
| ./usr/bin/Digestor |
| ./usr/bin/DigestorMotif |
| ./usr/bin/EICExtractor |
| ./usr/bin/ERPairFinder |
| ./usr/bin/ExecutePipeline |
| ./usr/bin/ExternalCalibration |
| ./usr/bin/FFEval |
| ./usr/bin/FalseDiscoveryRate |
| ./usr/bin/FeatureFinderCentroided |
| ./usr/bin/FeatureFinderIdentification |
| ./usr/bin/FeatureFinderIsotopeWavelet |
| ./usr/bin/FeatureFinderMRM |
| ./usr/bin/FeatureFinderMetabo |
| ./usr/bin/FeatureFinderMultiplex |
| ./usr/bin/FeatureFinderSuperHirn |
| ./usr/bin/FeatureLinkerLabeled |
| ./usr/bin/FeatureLinkerUnlabeled |
| ./usr/bin/FeatureLinkerUnlabeledKD |
| ./usr/bin/FeatureLinkerUnlabeledQT |
| ./usr/bin/FidoAdapter |
| ./usr/bin/FileConverter |
| ./usr/bin/FileFilter |
| ./usr/bin/FileInfo |
| ./usr/bin/FileMerger |
| ./usr/bin/FuzzyDiff |
| ./usr/bin/GenericWrapper |
| ./usr/bin/HighResPrecursorMassCorrector |
| ./usr/bin/IDConflictResolver |
| ./usr/bin/IDDecoyProbability |
| ./usr/bin/IDExtractor |
| ./usr/bin/IDFileConverter |
| ./usr/bin/IDFilter |
| ./usr/bin/IDMapper |
| ... and 300 more |