معرفی شرکت ها

samtools_1.10-3_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته samtools
نام فایل بسته samtools_1.10-3_amd64.deb
نسخه بسته 1.10
انتشار بسته 3
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.htslib.org/
مجوز -
حجم دانلود 496384
حجم نصب 1146
Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
samtools-test_1.10-3_all.deb 1.10 all Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 1.10 libhts3
>= 6 libncurses6
>= 6 libtinfo6
>= 1:1.1.4 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb samtools:

    sudo apt-get install samtools_1.10-3_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/ace2sam
./usr/bin/blast2sam.pl
./usr/bin/bowtie2sam.pl
./usr/bin/export2sam.pl
./usr/bin/interpolate_sam.pl
./usr/bin/maq2sam-long
./usr/bin/maq2sam-short
./usr/bin/md5fa
./usr/bin/md5sum-lite
./usr/bin/novo2sam.pl
./usr/bin/plot-bamstats
./usr/bin/psl2sam.pl
./usr/bin/sam2vcf.pl
./usr/bin/samtools
./usr/bin/samtools.pl
./usr/bin/seq_cache_populate.pl
./usr/bin/soap2sam.pl
./usr/bin/wgsim
./usr/bin/wgsim_eval.pl
./usr/bin/zoom2sam.pl
./usr/share/commonwl/samtools-faidx.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-index.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-rmdup.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-sort.cwl
./usr/share/commonwl/samtools-view.cwl
./usr/share/doc/samtools/AUTHORS
./usr/share/doc/samtools/NEWS.Debian.gz
./usr/share/doc/samtools/README
./usr/share/doc/samtools/README.Debian
./usr/share/doc/samtools/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/samtools/copyright
./usr/share/doc/samtools/examples/00README.txt
./usr/share/doc/samtools/examples/ex1.fa
./usr/share/doc/samtools/examples/ex1.sam.gz
./usr/share/doc/samtools/examples/toy.fa
./usr/share/doc/samtools/examples/toy.sam
./usr/share/lintian/overrides/samtools
./usr/share/man/man1/ace2sam.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-addreplacerg.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-bedcov.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-calmd.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-cat.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-collate.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-depad.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-depth.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-dict.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-faidx.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-fasta.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-fixmate.1.gz
./usr/share/man/man1/samtools-flags.1.gz
... and 22 more