معرفی شرکت ها
r-bioc-variantannotation_1.32.0-1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
BioConductor annotation of genetic variants
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Focal-20.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | r-bioc-variantannotation |
| نام فایل بسته | r-bioc-variantannotation_1.32.0-1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.32.0 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/VariantAnnotation/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 3159600 |
| حجم نصب | 4456 |
This BioConductor package provides R functions to annotate variants,
compute amino acid coding changess and to predict coding outcomes.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3.6.1-7 | r-base-core |
| - | r-api-3.5 |
| - | r-api-bioc-3.10 |
| >= 0.15.3 | r-bioc-biocgenerics |
| >= 1.15.2 | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 1.37.4 | r-bioc-genomicranges |
| >= 1.9.9 | r-bioc-summarizedexperiment |
| >= 1.99.0 | r-bioc-rsamtools |
| - | r-cran-dbi |
| - | r-bioc-zlibbioc |
| - | r-bioc-biobase |
| >= 0.17.24 | r-bioc-s4vectors |
| >= 2.13.13 | r-bioc-iranges |
| >= 0.19.7 | r-bioc-xvector |
| >= 2.47.6 | r-bioc-biostrings |
| >= 1.27.9 | r-bioc-annotationdbi |
| >= 1.39.7 | r-bioc-rtracklayer |
| >= 1.47.3 | r-bioc-bsgenome |
| >= 1.31.3 | r-bioc-genomicfeatures |
| >= 2.15 | libc6 |
| >= 7.18.0 | libcurl4 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-variantannotation:
sudo apt-get install r-bioc-variantannotation_1.32.0-1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/R/VariantAnnotation |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/R/VariantAnnotation.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/R/VariantAnnotation.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/VariantAnnotation.R |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/VariantAnnotation.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/VariantAnnotation.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/filterVcf.R |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/filterVcf.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/filterVcf.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr22.vcf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr22.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr7-sub.vcf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/chr7-sub.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/ex2.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/gl_chr1.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/h1187-10k.vcf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/h1187-10k.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/hapmap_exome_chr22.vcf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/hapmap_exome_chr22.vcf.gz.tbi |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/extdata/structural.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/VariantAnnotation.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/VariantAnnotation.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/libs/VariantAnnotation.so |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/scripts/test_Rplinkseq.R |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/FORMAT_header_no_SAMPLEs.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/VarScan_header.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/banded_gvcf.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/buffer_realloc.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/ex1-seq1-90.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/expand.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/fewer-FORMAT-than-GENO.vcf |
| ./usr/lib/R/site-library/VariantAnnotation/unitTests/cases/meta_header.vcf |
| ... and 26 more |