معرفی شرکت ها

r-bioc-bitseq_1.30.0+dfsg-1build1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

transcript expression inference and analysis for RNA-seq data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته r-bioc-bitseq
نام فایل بسته r-bioc-bitseq_1.30.0+dfsg-1build1_amd64.deb
نسخه بسته 1.30.0+dfsg
انتشار بسته 1build1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/BitSeq/
مجوز -
حجم دانلود 1141956
حجم نصب 5986
The BitSeq package is targeted for transcript expression analysis and differential expression analysis of RNA-seq data in two stage process. In the first stage it uses Bayesian inference methodology to infer expression of individual transcripts from individual RNA-seq experiments. The second stage of BitSeq embraces the differential expression analysis of transcript expression. Providing expression estimates from replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the estimates is used for inferring the condition mean transcript expression and ranking the transcripts based on the likelihood of differential expression.


نیازمندی

مقدار نام
>= 3.6.2.20200221-1build1 r-base-core
- r-api-3.5
- r-api-bioc-3.10
>= 1.99.3 r-bioc-rsamtools
- r-bioc-s4vectors
- r-bioc-iranges
>= 1.15.5 r-bioc-rhtslib
>= 2.29 libc6
>= 7.18.0 libcurl4
>= 3.0 libgcc-s1
>= 6 libgomp1
>= 5.2 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-bitseq:

    sudo apt-get install r-bioc-bitseq_1.30.0+dfsg-1build1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/CITATION
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/INDEX
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/NEWS
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/R/BitSeq
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/R/BitSeq.rdb
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/R/BitSeq.rdx
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/BitSeq.R
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/BitSeq.Rnw
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/BitSeq.pdf
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c0b0.sam
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c0b1.rpkm
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c1b0.rpkm
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/data-c1b1.rpkm
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/ensSelect1.fasta
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/ensSelect1.tr
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/extdata/parameters1.txt
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/BitSeq.rdb
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/BitSeq.rdx
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/html/R.css
./usr/lib/R/site-library/BitSeq/libs/BitSeq.so
./usr/share/doc/r-bioc-bitseq/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/r-bioc-bitseq/copyright