معرفی شرکت ها

pscan-chip_1.1-2build1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

ChIP-based identifcation of TF binding sites
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته pscan-chip
نام فایل بسته pscan-chip_1.1-2build1_amd64.deb
نسخه بسته 1.1
انتشار بسته 2build1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.beaconlab.it/pscan_chip_dev/
مجوز -
حجم دانلود 87552
حجم نصب 196
Regulation of transcription is one of the main check points of gene expression regulation and plays a key role in fundamental processes like cellular differentiation and dynamic molecular responses to stimuli The transcriptional activity of genes is finely regulated by the interaction of sequence elements on the DNA (transcription factor binding sites or TFBSs) and particular proteins called Transcription Factors (TFs). , TFBSs are usually clustered in specific regulatory genomic regions called promoters and enhancers. TFs usually recognize TFBSs in a loose sequence specific fashion but there is no computational way to determine if any given sequence motif on the DNA is actually bound in-vivo by a TF, even when the motif is an istance of the sequences typically bound by the TF itself. . Tools like Pscan and PscanChIP analyse a set of regulatory sequences to detect motif enrichment. The rationale is that if a given TFBS is present in a "surpisingly high" number of istances then there is a good chance that the TF that recognize that motif is a common regulator of the input sequences, thus they use redundancy as an information source. . While Pscan (of the pscan-tfbs package) is tailored to work on promoters, that is the regulatory regions upstream of transcription start sites, PscanChIP is suited to work on more general regulatory genomic regions like the ones identified through ChIP-Seq experiments.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
pscan-chip-data_1.1-2build1_all.deb 1.1 all Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 2.5 libgsl23
>= 5.2 libstdc++6


نحوه نصب


نصب پکیج deb pscan-chip:

    sudo apt-get install pscan-chip_1.1-2build1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/fasta_to_raw
./usr/bin/pscan_chip
./usr/share/doc/pscan-chip/README.Debian
./usr/share/doc/pscan-chip/README.docx.gz
./usr/share/doc/pscan-chip/README.txt.gz
./usr/share/doc/pscan-chip/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/pscan-chip/copyright
./usr/share/man/man1/fasta_to_raw.1.gz
./usr/share/man/man1/pscan_chip.1.gz