معرفی شرکت ها


proteinortho_6.0.14+dfsg-1_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته proteinortho
نام فایل بسته proteinortho_6.0.14+dfsg-1_amd64.deb
نسخه بسته 6.0.14+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
مجوز -
حجم دانلود 207412
حجم نصب 790
Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 6 libgomp1
- liblapack3
>= 5.2 libstdc++6
- perl:any
- python3
- ncbi-blast+
- diamond-aligner
- procps


نحوه نصب


نصب پکیج deb proteinortho:

    sudo apt-get install proteinortho_6.0.14+dfsg-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/proteinortho2html.pl
./usr/bin/proteinortho2tree.pl
./usr/bin/proteinortho2xml.pl
./usr/bin/proteinortho6.pl
./usr/bin/proteinortho_cleanupblastgraph
./usr/bin/proteinortho_clustering
./usr/bin/proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl
./usr/bin/proteinortho_do_mcl.pl
./usr/bin/proteinortho_extract_from_graph.pl
./usr/bin/proteinortho_ffadj_mcs.py
./usr/bin/proteinortho_formatUsearch.pl
./usr/bin/proteinortho_grab_proteins.pl
./usr/bin/proteinortho_graphMinusRemovegraph
./usr/bin/proteinortho_history.pl
./usr/bin/proteinortho_singletons.pl
./usr/bin/proteinortho_summary.pl
./usr/bin/proteinortho_treeBuilderCore
./usr/share/doc/proteinortho/README.test
./usr/share/doc/proteinortho/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/proteinortho/copyright
./usr/share/doc/proteinortho/examples/C.faa
./usr/share/doc/proteinortho/examples/C.gff
./usr/share/doc/proteinortho/examples/C2.faa
./usr/share/doc/proteinortho/examples/C2.gff
./usr/share/doc/proteinortho/examples/E.faa
./usr/share/doc/proteinortho/examples/E.gff
./usr/share/doc/proteinortho/examples/L.faa
./usr/share/doc/proteinortho/examples/L.gff
./usr/share/doc/proteinortho/examples/M.faa
./usr/share/doc/proteinortho/examples/M.gff
./usr/share/doc/proteinortho/examples/chk_test.pl
./usr/share/doc/proteinortho/run-unit-test
./usr/share/man/man1/proteinortho6.1.gz
./usr/bin/proteinortho -> proteinortho6.pl
./usr/share/man/man1/proteinortho.1.gz -> proteinortho6.1.gz