معرفی شرکت ها

prodigal_2.6.3-4_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته prodigal
نام فایل بسته prodigal_2.6.3-4_amd64.deb
نسخه بسته 1:2.6.3
انتشار بسته 4
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://prodigal.ornl.gov/
مجوز -
حجم دانلود 691520
حجم نصب 11928
Prodigal (Prokaryotic Dynamic Programming Genefinding Algorithm) is a microbial (bacterial and archaeal) gene finding program developed at Oak Ridge National Laboratory and the University of Tennessee. Key features of Prodigal include: . Speed: Prodigal is an extremely fast gene recognition tool (written in very vanilla C). It can analyze an entire microbial genome in 30 seconds or less. . Accuracy: Prodigal is a highly accurate gene finder. It correctly locates the 3' end of every gene in the experimentally verified Ecogene data set (except those containing introns). It possesses a very sophisticated ribosomal binding site scoring system that enables it to locate the translation initiation site with great accuracy (96% of the 5' ends in the Ecogene data set are located correctly). . Specificity: Prodigal's false positive rate compares favorably with other gene identification programs, and usually falls under 5%. . GC-Content Indifferent: Prodigal performs well even in high GC genomes, with over a 90% perfect match (5'+3') to the Pseudomonas aeruginosa curated annotations. . Metagenomic Version: Prodigal can run in metagenomic mode and analyze sequences even when the organism is unknown. . Ease of Use: Prodigal can be run in one step on a single genomic sequence or on a draft genome containing many sequences. It does not need to be supplied with any knowledge of the organism, as it learns all the properties it needs to on its own.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6


نحوه نصب


نصب پکیج deb prodigal:

    sudo apt-get install prodigal_2.6.3-4_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/prodigal
./usr/share/doc/prodigal/README.md
./usr/share/doc/prodigal/README.test
./usr/share/doc/prodigal/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/prodigal/copyright
./usr/share/doc/prodigal/run-unit-test
./usr/share/doc/prodigal/test-data/genome.fna.gz
./usr/share/man/man1/prodigal.1.gz