معرفی شرکت ها

ncbi-blast+_2.9.0-3_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

next generation suite of BLAST sequence search tools
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته ncbi-blast+
نام فایل بسته ncbi-blast+_2.9.0-3_amd64.deb
نسخه بسته 2.9.0
انتشار بسته 3
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/CPP_DOC/
مجوز -
حجم دانلود 11067636
حجم نصب 47503
The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
ncbi-blast+-legacy_2.9.0-2_all.deb 2.9.0 all Ubuntu universe
ncbi-blast+-legacy_2.9.0-3_all.deb 2.9.0 all Ubuntu universe
ncbi-blast+_2.9.0-2_amd64.deb 2.9.0 amd64 Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
- ncbi-data
- python3
- perl:any
- libbz2-1.0
>= 2.29 libc6
>= 1:3.0 libgcc1
>= 6 libgomp1
>= 0.9.7 liblmdb0
>= 2.13 libmbedcrypto3
>= 2.13 libmbedtls12
- libpcre3
>= 9 libstdc++6
>= 1:1.2.11 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb ncbi-blast+:

    sudo apt-get install ncbi-blast+_2.9.0-3_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/blast_formatter
./usr/bin/blast_report
./usr/bin/blastdb_aliastool
./usr/bin/blastdb_convert
./usr/bin/blastdb_path
./usr/bin/blastdbcheck
./usr/bin/blastdbcmd
./usr/bin/blastdbcp
./usr/bin/blastn
./usr/bin/blastp
./usr/bin/blastx
./usr/bin/convert2blastmask
./usr/bin/deltablast
./usr/bin/dustmasker
./usr/bin/gene_info_reader
./usr/bin/get_species_taxids
./usr/bin/legacy_blast
./usr/bin/makeblastdb
./usr/bin/makembindex
./usr/bin/makeprofiledb
./usr/bin/psiblast
./usr/bin/rpsblast+
./usr/bin/rpstblastn
./usr/bin/seedtop+
./usr/bin/segmasker
./usr/bin/tblastn
./usr/bin/tblastx
./usr/bin/update_blastdb
./usr/bin/windowmasker
./usr/bin/windowmasker_2.2.22_adapter
./usr/bin/windowmasker_2.2.22_adapter.bak
./usr/lib/ncbi-blast+/libalign_format.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libbiblio.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblast.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblast_services.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblastdb.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblastdb_format.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblastinput.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblastxml.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libblastxml2.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libcomposition_adjustment.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libcreaders.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libgbseq.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libgene_info.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libgeneral.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libgenome_collection.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libid1.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libid2.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libmedlars.so
./usr/lib/ncbi-blast+/libmedline.so
... and 56 more