معرفی شرکت ها


libbio-samtools-perl_1.43-2build2_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته libbio-samtools-perl
نام فایل بسته libbio-samtools-perl_1.43-2build2_amd64.deb
نسخه بسته 1.43
انتشار بسته 2build2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://metacpan.org/release/Bio-SamTools
مجوز -
حجم دانلود 192588
حجم نصب 630
Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
libbio-samtools-perl_1.43-2build1_amd64.deb 1.43 amd64 Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
>= 5.30.0-9ubuntu0.2 perl
- perlapi-5.30.0
>= 2.15 libc6
>= 1:1.2.3.3 zlib1g
- libbio-perl-perl


نحوه نصب


نصب پکیج deb libbio-samtools-perl:

    sudo apt-get install libbio-samtools-perl_1.43-2build2_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/bam2bedgraph
./usr/bin/bamToGBrowse.pl
./usr/bin/chrom_sizes.pl
./usr/bin/genomeCoverageBed.pl
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/AlignWrapper.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/Alignment.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/FetchIterator.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/Pileup.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/PileupWrapper.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/Query.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/ReadIterator.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Bam/Target.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Sam/Constants.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Sam/SamToGBrowse.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Sam/Segment.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/Bio/DB/Sam.pm
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/auto/Bio/DB/Sam/Sam.bs
./usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.30/auto/Bio/DB/Sam/Sam.so
./usr/share/doc/libbio-samtools-perl/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/libbio-samtools-perl/copyright
./usr/share/lintian/overrides/libbio-samtools-perl
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Bam::AlignWrapper.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Bam::Alignment.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Bam::Pileup.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Bam::PileupWrapper.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Bam::Query.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Bam::Target.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Sam.3pm.gz
./usr/share/man/man3/Bio::DB::Sam::Constants.3pm.gz