معرفی شرکت ها
indelible_1.03-4build1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
powerful and flexible simulator of biological evolution
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Focal-20.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | indelible |
| نام فایل بسته | indelible_1.03-4build1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.03 |
| انتشار بسته | 4build1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/indelible/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 385344 |
| حجم نصب | 1104 |
INDELible is a new, portable, and flexible application for biological
sequence simulation that combines many features in the same place for
the first time. Using a length-dependent model of indel formation it
can simulate evolution of multi-partitioned nucleotide, amino-acid,
or codon data sets through the processes of insertion, deletion, and
substitution in continuous time.
.
Nucleotide simulations may use the general unrestricted model or the
general time reversible model and its derivatives, and amino-acid
simulations can be conducted using fifteen different empirical rate
matrices. Substitution rate heterogeneity can be modeled via the
continuous and discrete gamma distributions, with or without a proportion
of invariant sites. INDELible can also simulate under non-homogeneous
and non-stationary conditions where evolutionary models are permitted
to change across a phylogeny.
.
Unique among indel simulation programs, INDELible offers the ability
to simulate using codon models that exhibit nonsynonymous/synonymous
rate ratio heterogeneity among sites and/or lineages.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 2.29 | libc6 |
| >= 3.0 | libgcc-s1 |
| >= 9 | libstdc++6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb indelible:
sudo apt-get install indelible_1.03-4build1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/indelible |
| ./usr/share/doc/indelible/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/copyright |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/AMINOACID.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/CODON.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/CODONsites.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/NUCLEOTIDE.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/basic.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/basicaminoacid.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/basiccodon.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/basicnucleotide.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/branch.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/branch2.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/codon_RATES.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/indels.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/multi-partitions.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/mylengthmodel.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/nucleotide-branch.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/nucleotide_RATES.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/random_branch_length_trees.JPG |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/rates.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/settings.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/sitebranch.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/trees.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/trees.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/example_files/userAAmodel.txt |
| ./usr/share/doc/indelible/help/examples.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/index.html |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/branches.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/codon_RATES.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/evolve.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/model.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/mylengthmodel.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/nucleotide_RATES.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/partitions.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/random_branch_length_trees.JPG |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/settings.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/symQmatrix.gif |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/tree.shtml.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/trees.txt.gz |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/type.shtml |
| ./usr/share/doc/indelible/help/manual_files/userAAmodel.txt |
| ./usr/share/doc-base/indelible |
| ./usr/share/man/man1/indelible.1.gz |