معرفی شرکت ها

circlator_1.5.6-1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

circularize genome assemblies
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته circlator
نام فایل بسته circlator_1.5.6-1_amd64.deb
نسخه بسته 1.5.6
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://sanger-pathogens.github.io/circlator/
مجوز -
حجم دانلود 4327536
حجم نصب 10302
Circlator is a tool to automate assembly circularization for bacterial and small eukaryotic genomes and produce accurate linear representations of circular sequences.


نیازمندی

مقدار نام
>= 3.12.1 fastaq
- python3-openpyxl
- python3-pymummer
- python3-pysam
- python3:any
- prodigal
>= 0.7.12 bwa
- mummer
- samtools
- spades


نحوه نصب


نصب پکیج deb circlator:

    sudo apt-get install circlator_1.5.6-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/circlator
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/assemble.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/assembly.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/bamfilter.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/clean.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/common.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/dnaA.fasta
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/test_contigs.fa
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/test_for_reads.fa
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/test_make_data.sh
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/test_reads.fq.gz
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/test_ref.fa
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/data/test_ref.fa.fai
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/dnaa.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/external_progs.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/mapping.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/merge.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/minimus2.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/program.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/start_fixer.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/all.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/assemble.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/bam2reads.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/clean.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/fixstart.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/get_dnaa.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/mapreads.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/merge.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/minimus2.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/progcheck.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/test.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/tasks/version.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator/versions.py
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator-1.5.5.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator-1.5.5.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator-1.5.5.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/circlator-1.5.5.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/circlator/README.md.gz
./usr/share/doc/circlator/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/circlator/copyright
./usr/share/man/man1/circlator.1.gz