معرفی شرکت ها

bitseq_0.7.5+dfsg-5build1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته bitseq
نام فایل بسته bitseq_0.7.5+dfsg-5build1_amd64.deb
نسخه بسته 0.7.5+dfsg
انتشار بسته 5build1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/BitSeq/BitSeq
مجوز -
حجم دانلود 349292
حجم نصب 1903
BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 6 libgomp1
>= 5.2 libstdc++6
>= 1:1.2.3.3 zlib1g
- python3
- python3-numpy


نحوه نصب


نصب پکیج deb bitseq:

    sudo apt-get install bitseq_0.7.5+dfsg-5build1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/convertSamples
./usr/bin/estimateDE
./usr/bin/estimateExpression
./usr/bin/estimateHyperPar
./usr/bin/estimateVBExpression
./usr/bin/extractSamples
./usr/bin/getFoldChange
./usr/bin/getGeneExpression
./usr/bin/getPPLR
./usr/bin/getVariance
./usr/bin/getWithinGeneExpression
./usr/bin/parseAlignment
./usr/bin/transposeLargeFile
./usr/lib/debian-med/bin/biocUpdate.sh
./usr/lib/debian-med/bin/checkTR.py
./usr/lib/debian-med/bin/extractTranscriptInfo.py
./usr/lib/debian-med/bin/getCounts.py
./usr/lib/debian-med/bin/parseAlignment.py
./usr/share/doc/bitseq/README.Debian
./usr/share/doc/bitseq/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/bitseq/copyright
./usr/share/man/man1/convertSamples.1.gz
./usr/share/man/man1/estimateDE.1.gz
./usr/share/man/man1/estimateExpression.1.gz
./usr/share/man/man1/estimateHyperPar.1.gz
./usr/share/man/man1/estimateVBExpression.1.gz
./usr/share/man/man1/extractSamples.1.gz
./usr/share/man/man1/extractTranscriptInfo.1.gz
./usr/share/man/man1/getCounts.1.gz
./usr/share/man/man1/getFoldChange.1.gz
./usr/share/man/man1/getGeneExpression.1.gz
./usr/share/man/man1/getPPLR.1.gz
./usr/share/man/man1/getVariance.1.gz
./usr/share/man/man1/getWithinGeneExpression.1.gz
./usr/share/man/man1/parseAlignment.1.gz
./usr/share/man/man1/transposeLargeFile.1.gz
./usr/bin/biocUpdate -> ../lib/debian-med/bin/biocUpdate.sh
./usr/bin/checkTR -> ../lib/debian-med/bin/checkTR.py
./usr/bin/extractTranscriptInfo -> ../lib/debian-med/bin/extractTranscriptInfo.py
./usr/bin/getCounts -> ../lib/debian-med/bin/getCounts.py