معرفی شرکت ها


ampliconnoise_1.29-8_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته ampliconnoise
نام فایل بسته ampliconnoise_1.29-8_amd64.deb
نسخه بسته 1.29
انتشار بسته 8
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/lanzen/ampliconnoise
مجوز -
حجم دانلود 473732
حجم نصب 1431
AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts: . Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences . Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6
>= 2.5 libgsl23
- libopenmpi3
- mafft


نحوه نصب


نصب پکیج deb ampliconnoise:

    sudo apt-get install ampliconnoise_1.29-8_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/FCluster
./usr/bin/FastaUnique
./usr/bin/NDist
./usr/bin/Perseus
./usr/bin/PerseusD
./usr/bin/PyroDist
./usr/bin/PyroNoise
./usr/bin/PyroNoiseA
./usr/bin/PyroNoiseM
./usr/bin/SeqDist
./usr/bin/SeqNoise
./usr/bin/SplitClusterClust
./usr/bin/SplitClusterEven
./usr/share/ampliconnoise/Data/LookUp.dat
./usr/share/ampliconnoise/Data/LookUp_E123.dat
./usr/share/ampliconnoise/Data/LookUp_Titanium.dat
./usr/share/ampliconnoise/Data/Tran.dat
./usr/share/ampliconnoise/Data/TranN.dat
./usr/share/ampliconnoise/Data/Tran_D.dat
./usr/share/ampliconnoise/Data/Tran_V6.dat
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CSV.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Class.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Clean.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Clean360.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanAcyclic.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanBoth.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanBothM.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanMinMax.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CleanMinMax.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/ConvertDatFasta.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CountFasta.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/CountSequences.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Diversity.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FilterGoodClass.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FlowsFA.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FlowsFA360.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/FlowsMinMax.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Join.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Map.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/MedianS.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Parse.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/ParseBoth.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Qiime.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Qiime_OTU.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/Qiime_Typical.pl
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunBoth.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunBothFLX.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunFLX.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunTitanium.sh
./usr/share/ampliconnoise/Scripts/RunTitaniumA.sh
... and 31 more