معرفی شرکت ها

r-bioc-qusage_2.20.0-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

qusage: Quantitative Set Analysis for Gene Expression
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته r-bioc-qusage
نام فایل بسته r-bioc-qusage_2.20.0-1_all.deb
نسخه بسته 2.20.0
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://bioconductor.org/packages/qusage/
مجوز -
حجم دانلود 9992380
حجم نصب 10022
This package is an implementation the Quantitative Set Analysis for Gene Expression (QuSAGE) method described in (Yaari G. et al, Nucl Acids Res, 2013). This is a novel Gene Set Enrichment-type test, which is designed to provide a faster, more accurate, and easier to understand test for gene expression studies. qusage accounts for inter-gene correlations using the Variance Inflation Factor technique proposed by Wu et al. (Nucleic Acids Res, 2012). In addition, rather than simply evaluating the deviation from a null hypothesis with a single number (a P value), qusage quantifies gene set activity with a complete probability density function (PDF). From this PDF, P values and confidence intervals can be easily extracted. Preserving the PDF also allows for post-hoc analysis (e.g., pair-wise comparisons of gene set activity) while maintaining statistical traceability. Finally, while qusage is compatible with individual gene statistics from existing methods (e.g., LIMMA), a Welch-based method is implemented that is shown to improve specificity. For questions, contact Chris Bolen (cbolen1@gmail.com) or Steven Kleinstein (steven.kleinstein@yale.edu)


نیازمندی

مقدار نام
>= 3.6.1-7 r-base-core
- r-api-3.5
- r-api-bioc-3.10
>= 3.14 r-bioc-limma
- r-bioc-biobase
- r-cran-nlme
- r-cran-emmeans


نحوه نصب


نصب پکیج deb r-bioc-qusage:

    sudo apt-get install r-bioc-qusage_2.20.0-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/R/site-library/qusage/CITATION
./usr/lib/R/site-library/qusage/DESCRIPTION
./usr/lib/R/site-library/qusage/INDEX
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/Rd.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/data.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/features.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/hsearch.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/links.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/nsInfo.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/package.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/Meta/vignette.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/NAMESPACE
./usr/lib/R/site-library/qusage/R/qusage
./usr/lib/R/site-library/qusage/R/qusage.rdb
./usr/lib/R/site-library/qusage/R/qusage.rdx
./usr/lib/R/site-library/qusage/data/GeneSets.RData
./usr/lib/R/site-library/qusage/data/datalist
./usr/lib/R/site-library/qusage/data/fluExample.RData
./usr/lib/R/site-library/qusage/data/fluVaccine.RData
./usr/lib/R/site-library/qusage/doc/index.html
./usr/lib/R/site-library/qusage/doc/qusage.R
./usr/lib/R/site-library/qusage/doc/qusage.Rnw
./usr/lib/R/site-library/qusage/doc/qusage.pdf
./usr/lib/R/site-library/qusage/help/AnIndex
./usr/lib/R/site-library/qusage/help/aliases.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/help/paths.rds
./usr/lib/R/site-library/qusage/help/qusage.rdb
./usr/lib/R/site-library/qusage/help/qusage.rdx
./usr/lib/R/site-library/qusage/html/00Index.html
./usr/lib/R/site-library/qusage/html/R.css
./usr/share/doc/r-bioc-qusage/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/r-bioc-qusage/copyright