معرفی شرکت ها

python3-presto_0.5.13-2_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

toolkit for processing B and T cell sequences
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته python3-presto
نام فایل بسته python3-presto_0.5.13-2_all.deb
نسخه بسته 0.5.13
انتشار بسته 2
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://presto.readthedocs.io
مجوز -
حجم دانلود 71464
حجم نصب 490
pRESTO is a toolkit for processing raw reads from high-throughput sequencing of B cell and T cell repertoires. . Dramatic improvements in high-throughput sequencing technologies now enable large-scale characterization of lymphocyte repertoires, defined as the collection of trans-membrane antigen-receptor proteins located on the surface of B cells and T cells. The REpertoire Sequencing TOolkit (pRESTO) is composed of a suite of utilities to handle all stages of sequence processing prior to germline segment assignment. pRESTO is designed to handle either single reads or paired-end reads. It includes features for quality control, primer masking, annotation of reads with sequence embedded barcodes, generation of unique molecular identifier (UMI) consensus sequences, assembly of paired-end reads and identification of duplicate sequences. Numerous options for sequence sorting, sampling and conversion operations are also included.


نیازمندی

مقدار نام
>= 1.65 python3-biopython
- python3-numpy
>= 0.15 python3-pandas
- python3-scipy
- python3:any


نحوه نصب


نصب پکیج deb python3-presto:

    sudo apt-get install python3-presto_0.5.13-2_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/AlignSets.py
./usr/bin/AssemblePairs.py
./usr/bin/BuildConsensus.py
./usr/bin/ClusterSets.py
./usr/bin/CollapseSeq.py
./usr/bin/ConvertHeaders.py
./usr/bin/EstimateError.py
./usr/bin/FilterSeq.py
./usr/bin/MaskPrimers.py
./usr/bin/PairSeq.py
./usr/bin/ParseHeaders.py
./usr/bin/ParseLog.py
./usr/bin/SplitSeq.py
./usr/bin/UnifyHeaders.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Annotation.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Applications.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Commandline.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Defaults.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/IO.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Multiprocessing.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Sequence.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/Version.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto/__init__.py
./usr/lib/python3/dist-packages/presto-0.5.13.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python3/dist-packages/presto-0.5.13.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/presto-0.5.13.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python3/dist-packages/presto-0.5.13.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python3/dist-packages/presto-0.5.13.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/python3-presto/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/python3-presto/copyright
./usr/share/lintian/overrides/python3-presto