معرفی شرکت ها

python3-hisat2_2.1.0-4_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Python scripts accompanying hisat2
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته python3-hisat2
نام فایل بسته python3-hisat2_2.1.0-4_all.deb
نسخه بسته 2.1.0
انتشار بسته 4
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtml
مجوز -
حجم دانلود 12404
حجم نصب 78
HISAT2 is a fast and sensitive alignment program for mapping next- generation sequencing reads (both DNA and RNA) to a population of human genomes (as well as against a single reference genome). Based on an extension of BWT for graphs a graph FM index (GFM) was designed and implementd. In addition to using one global GFM index that represents a population of human genomes, HISAT2 uses a large set of small GFM indexes that collectively cover the whole genome (each index representing a genomic region of 56 Kbp, with 55,000 indexes needed to cover the human population). These small indexes (called local indexes), combined with several alignment strategies, enable rapid and accurate alignment of sequencing reads. This new indexing scheme is called a Hierarchical Graph FM index (HGFM). . This package provides a serires of platform-independent scripts that are typically expected to be co-installed with the hisat2 binary.


نیازمندی

مقدار نام
- hisat2
- python3


نحوه نصب


نصب پکیج deb python3-hisat2:

    sudo apt-get install python3-hisat2_2.1.0-4_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/hisat2_extract_exons.py
./usr/bin/hisat2_extract_snps_haplotypes_UCSC.py
./usr/bin/hisat2_extract_snps_haplotypes_VCF.py
./usr/bin/hisat2_extract_splice_sites.py
./usr/share/doc/python3-hisat2/copyright
./usr/share/lintian/overrides/python3-hisat2
./usr/share/doc/python3-hisat2/changelog.Debian.gz -> ../hisat2/changelog.Debian.gz