معرفی شرکت ها
python3-gffutils_0.10.1-2_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Focal-20.04 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | python3-gffutils |
| نام فایل بسته | python3-gffutils_0.10.1-2_all.deb |
| نسخه بسته | 0.10.1 |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://daler.github.io/gffutils |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1028480 |
| حجم نصب | 9642 |
A Python package for working with and manipulating the GFF and GTF format
files typically used for genomic annotations. Files are loaded into a
sqlite3 database, allowing much more complex manipulation of hierarchical
features (e.g., genes, transcripts, and exons) than is possible with
plain-text methods alone.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3-argcomplete |
| - | python3-argh |
| - | python3-pyfaidx |
| - | python3-simplejson |
| >= 1.12.0 | python3-six |
| - | python3:any |
| - | python3-biopython |
نحوه نصب
نصب پکیج deb python3-gffutils:
sudo apt-get install python3-gffutils_0.10.1-2_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/gffutils-cli |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/attributes.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/bins.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/biopython_integration.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/constants.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/convert.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/create.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/exceptions.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/feature.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/gffwriter.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/helpers.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/inspect.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/interface.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/iterators.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/merge_criteria.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/parser.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/pybedtools_integration.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/scripts/gffutils-flybase-convert.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/attr_test_cases.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/F3-unique-3.v2.gff |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/FBgn0031208.gff |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/FBgn0031208.gtf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.83.5000_gene_ids.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.83.5000_transcript_ids.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/Saccharomyces_cerevisiae.R64-1-1.83.chromsizes.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/c_elegans_WS199_ann_gff.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/c_elegans_WS199_dna_shortened.fa |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/c_elegans_WS199_shortened_gff.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/dm6-chr2L.fa |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/dm6-chr2L.fa.fai |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/dmel-all-no-analysis-r5.49_50k_lines.gff |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/download-large-annotation-files.sh |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/ensembl_gtf.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/gencode-v19.gtf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/gencode.vM8.5000_gene_ids.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/gencode.vM8.5000_transcript_ids.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/gencode.vM8.chromsizes.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/gff_example1.gff3 |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/gff_example1.gff3.gz |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/glimmer_nokeyval.gff3 |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/hybrid1.gff3 |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/intro_docs_example.gff |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/jgi_gff2.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/keep-order-test.gtf |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/keyval_sep_in_attrs.gff |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/mouse_extra_comma.gff3 |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/ncbi_gff3.txt |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/gffutils/test/data/nonascii |
| ... and 37 more |