معرفی شرکت ها

prokka_1.14.5+dfsg-2_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

rapid annotation of prokaryotic genomes
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته prokka
نام فایل بسته prokka_1.14.5+dfsg-2_all.deb
نسخه بسته 1.14.5+dfsg
انتشار بسته 2
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://www.vicbioinformatics.com/software.prokka.shtml
مجوز -
حجم دانلود 9964312
حجم نصب 92547
A typical 4 Mbp genome can be fully annotated in less than 10 minutes on a quad-core computer, and scales well to 32 core SMP systems. It produces GFF3, GBK and SQN files that are ready for editing in Sequin and ultimately submitted to Genbank/DDJB/ENA.


نیازمندی

مقدار نام
- perl:any
- parallel
- libbio-perl-perl
>= 2.8 ncbi-blast+
- hmmer
- aragorn
- prodigal
- ncbi-tools-bin
- infernal
- libswiss-perl
- libxml-simple-perl
- default-jre
- less
- libbio-searchio-hmmer-perl


نحوه نصب


نصب پکیج deb prokka:

    sudo apt-get install prokka_1.14.5+dfsg-2_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/prokka
./usr/bin/prokka-biocyc_to_fasta_db
./usr/bin/prokka-cdd_to_hmm
./usr/bin/prokka-clusters_to_hmm
./usr/bin/prokka-genbank_to_fasta_db
./usr/bin/prokka-genpept_to_fasta_db
./usr/bin/prokka-hamap_to_hmm
./usr/bin/prokka-uniprot_to_fasta_db
./usr/share/doc/prokka/README.Debian
./usr/share/doc/prokka/README.md.gz
./usr/share/doc/prokka/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/prokka/copyright
./usr/share/doc/prokka/get-additional-data
./usr/share/lintian/overrides/prokka
./usr/share/man/man1/prokka-biocyc_to_fasta_db.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka-cdd_to_hmm.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka-clusters_to_hmm.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka-genbank_to_fasta_db.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka-genpept_to_fasta_db.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka-hamap_to_hmm.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka-uniprot_to_fasta_db.1.gz
./usr/share/man/man1/prokka.1.gz
./usr/share/prokka/db/cm/Archaea
./usr/share/prokka/db/cm/Bacteria
./usr/share/prokka/db/cm/README
./usr/share/prokka/db/cm/Viruses
./usr/share/prokka/db/cm/__build/.gitignore
./usr/share/prokka/db/cm/__build/Rfam_archaea_14.1.txt
./usr/share/prokka/db/cm/__build/Rfam_bacteria_14.1.txt
./usr/share/prokka/db/cm/__build/Rfam_viruses_14.1.txt
./usr/share/prokka/db/cm/__build/archaea.sql
./usr/share/prokka/db/cm/__build/bacteria.sql
./usr/share/prokka/db/cm/__build/update.sh
./usr/share/prokka/db/cm/__build/viruses.sql
./usr/share/prokka/db/genus/Enterococcus
./usr/share/prokka/db/genus/Escherichia
./usr/share/prokka/db/genus/Staphylococcus
./var/lib/prokka/db/cm/Archaea -> /usr/share/prokka/db/cm/Archaea
./var/lib/prokka/db/cm/Bacteria -> /usr/share/prokka/db/cm/Bacteria
./var/lib/prokka/db/cm/README -> /usr/share/prokka/db/cm/README
./var/lib/prokka/db/cm/Viruses -> /usr/share/prokka/db/cm/Viruses
./var/lib/prokka/db/cm/__build/.gitignore -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/.gitignore
./var/lib/prokka/db/cm/__build/Rfam_archaea_14.1.txt -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/Rfam_archaea_14.1.txt
./var/lib/prokka/db/cm/__build/Rfam_bacteria_14.1.txt -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/Rfam_bacteria_14.1.txt
./var/lib/prokka/db/cm/__build/Rfam_viruses_14.1.txt -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/Rfam_viruses_14.1.txt
./var/lib/prokka/db/cm/__build/archaea.sql -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/archaea.sql
./var/lib/prokka/db/cm/__build/bacteria.sql -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/bacteria.sql
./var/lib/prokka/db/cm/__build/update.sh -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/update.sh
./var/lib/prokka/db/cm/__build/viruses.sql -> /usr/share/prokka/db/cm/__build/viruses.sql
./var/lib/prokka/db/genus/Enterococcus -> /usr/share/prokka/db/genus/Enterococcus
./var/lib/prokka/db/genus/Escherichia -> /usr/share/prokka/db/genus/Escherichia
./var/lib/prokka/db/genus/Staphylococcus -> /usr/share/prokka/db/genus/Staphylococcus