معرفی شرکت ها
pbhoney_15.8.24+dfsg-4_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
genomic structural variation discovery
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Focal-20.04 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | pbhoney |
| نام فایل بسته | pbhoney_15.8.24+dfsg-4_all.deb |
| نسخه بسته | 15.8.24+dfsg |
| انتشار بسته | 4 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://sourceforge.net/projects/pb-jelly |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 1306696 |
| حجم نصب | 2353 |
PBHoney is an implementation of two variant-identification
approaches designed to exploit the high mappability of long reads
(i.e., greater than 10,000 bp). PBHoney considers both intra-read
discordance and soft-clipped tails of long reads to identify
structural variants.
.
PBHoney is part of the PBSuite.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | python3:any |
| = 15.8.24+dfsg-4 | python3-pbsuite-utils |
| = 15.8.24+dfsg-4 | python3-pbbanana |
| >= 0.8.0 | python3-pysam |
| - | python3-networkx |
| - | python3-h5py |
| - | python3-numpy |
| - | python3-intervaltree-bio |
| >= 5.3 | blasr |
| - | samtools |
نحوه نصب
نصب پکیج deb pbhoney:
sudo apt-get install pbhoney_15.8.24+dfsg-4_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/ComplexResolver.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/Force.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/HSpots.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/HSpots.pyx |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/Honey.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/SVMachines.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/TGraf.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/Valid.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/bakH.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/bampie.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/massivePhrap.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/realign.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/recallSpots.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/spotH5Merge.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/spotH5dump.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/spotToBed.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/spotToVCF.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/model |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/notes |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/range |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/scale |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/scale.out |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/scale.png |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul1.svm/train |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/metrics |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/model |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/notes |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/range |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/scale |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/scale.out |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/scale.png |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/svm/ecoli_jul12.svm/train |
| ./usr/share/doc/pbhoney/HoneyReadme.txt.gz |
| ./usr/share/doc/pbhoney/README.Debian |
| ./usr/share/doc/pbhoney/copyright |
| ./usr/share/doc/pbhoney/examples/filtered_subreads.fastq.gz |
| ./usr/share/doc/pbhoney/examples/lambda_modified.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/pbhoney/examples/lambda_reference.fasta.gz |
| ./usr/share/doc/pbhoney/examples/modify.py |
| ./usr/share/doc/pbhoney/examples/workflow.sh |
| ./usr/share/man/man1/Honey.1.gz |
| ./usr/bin/Honey -> ../lib/python3/dist-packages/pbsuite/honey/Honey.py |
| ./usr/bin/Honey.py -> Honey |
| ./usr/share/doc/pbhoney/changelog.Debian.gz -> ../python3-pbsuite-utils/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/man/man1/Honey.py.1.gz -> Honey.1.gz |