معرفی شرکت ها
chromhmm-example_1.20+dfsg-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Chromatin state discovery and characterization (example)
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Focal-20.04 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | chromhmm-example |
| نام فایل بسته | chromhmm-example_1.20+dfsg-1_all.deb |
| نسخه بسته | 1.20+dfsg |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://compbio.mit.edu/ChromHMM/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 38045620 |
| حجم نصب | 37363 |
ChromHMM is software for learning and characterizing chromatin states.
ChromHMM can integrate multiple chromatin datasets such as ChIP-seq data of
various histone modifications to discover de novo the major re-occuring
combinatorial and spatial patterns of marks. ChromHMM is based on a
multivariate Hidden Markov Model that explicitly models the presence or
absence of each chromatin mark. The resulting model can then be used to
systematically annotate a genome in one or more cell types. By automatically
computing state enrichments for large-scale functional and annotation datasets
ChromHMM facilitates the biological characterization of each state. ChromHMM
also produces files with genome-wide maps of chromatin state annotations that
can be directly visualized in a genome browser.
.
This package provides example to work with ChromHMM.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - |
نحوه نصب
نصب پکیج deb chromhmm-example:
sudo apt-get install chromhmm-example_1.20+dfsg-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/ce10/RefSeqTES.ce10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/ce10/RefSeqTSS.ce10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/ce11/RefSeqTES.ce11.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/ce11/RefSeqTSS.ce11.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/ce6/RefSeqTES.ce6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/ce6/RefSeqTSS.ce6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/danRer10/RefSeqTES.danRer10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/danRer10/RefSeqTSS.danRer10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/danRer11/RefSeqTES.danRer11.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/danRer11/RefSeqTSS.danRer11.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/danRer7/RefSeqTES.danRer7.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/danRer7/RefSeqTSS.danRer7.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/dm3/RefSeqTES.dm3.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/dm3/RefSeqTSS.dm3.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/dm6/RefSeqTES.dm6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/dm6/RefSeqTSS.dm6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/hg18/RefSeqTES.hg18.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/hg18/RefSeqTSS.hg18.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/hg19/RefSeqTES.hg19.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/hg19/RefSeqTSS.hg19.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/hg38/RefSeqTES.hg38.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/hg38/RefSeqTSS.hg38.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/mm10/RefSeqTES.mm10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/mm10/RefSeqTSS.mm10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/mm9/RefSeqTES.mm9.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/mm9/RefSeqTSS.mm9.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/rn5/RefSeqTES.rn5.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/rn5/RefSeqTSS.rn5.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/rn6/RefSeqTES.rn6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/ANCHORFILES/rn6/RefSeqTSS.rn6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/ce10.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/ce11.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/ce6.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/danRer10.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/danRer11.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/danRer7.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/dm3.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/dm6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/hg18.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/hg19.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/hg38.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/mm10.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/mm9.txt |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/rn5.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/CHROMSIZES/rn6.txt.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/COORDS/ce10/RefSeqExon.ce10.bed.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/COORDS/ce10/RefSeqGene.ce10.bed.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/COORDS/ce10/RefSeqTES.ce10.bed.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/COORDS/ce10/RefSeqTSS.ce10.bed.gz |
| ./usr/share/doc/chromhmm/examples/COORDS/ce10/RefSeqTSS2kb.ce10.bed.gz |
| ... and 84 more |