معرفی شرکت ها


abyss_2.2.4-1_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

de novo, parallel, sequence assembler for short reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Focal-20.04
مخزن Ubuntu multiverse amd64
نام بسته abyss
نام فایل بسته abyss_2.2.4-1_amd64.deb
نسخه بسته 2.2.4
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/bcgsc/abyss
مجوز -
حجم دانلود 3041008
حجم نصب 9393
ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.


نیازمندی

مقدار نام
- make
>= 2.29 libc6
>= 3.0 libgcc-s1
>= 4.9 libgomp1
>= 4.0.2 libopenmpi3
>= 3.5.9 libsqlite3-0
>= 9 libstdc++6
- perl:any
- bsdmainutils
- openmpi-common
- openmpi-bin


نحوه نصب


نصب پکیج deb abyss:

    sudo apt-get install abyss_2.2.4-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/DistanceEst
./usr/bin/abyss-fixmate
./usr/bin/abyss-pe
./usr/lib/abyss/ABYSS
./usr/lib/abyss/ABYSS-P
./usr/lib/abyss/AdjList
./usr/lib/abyss/Consensus
./usr/lib/abyss/DAssembler
./usr/lib/abyss/DistanceEst
./usr/lib/abyss/DistanceEst-ssq
./usr/lib/abyss/KAligner
./usr/lib/abyss/MergeContigs
./usr/lib/abyss/MergePaths
./usr/lib/abyss/Overlap
./usr/lib/abyss/ParseAligns
./usr/lib/abyss/PathConsensus
./usr/lib/abyss/PathOverlap
./usr/lib/abyss/PopBubbles
./usr/lib/abyss/SimpleGraph
./usr/lib/abyss/abyss-align
./usr/lib/abyss/abyss-bloom
./usr/lib/abyss/abyss-bloom-dbg
./usr/lib/abyss/abyss-bloom-dist.mk
./usr/lib/abyss/abyss-bowtie
./usr/lib/abyss/abyss-bowtie2
./usr/lib/abyss/abyss-bwa
./usr/lib/abyss/abyss-bwamem
./usr/lib/abyss/abyss-bwasw
./usr/lib/abyss/abyss-db-csv
./usr/lib/abyss/abyss-db-txt
./usr/lib/abyss/abyss-dida
./usr/lib/abyss/abyss-fac
./usr/lib/abyss/abyss-fatoagp
./usr/lib/abyss/abyss-filtergraph
./usr/lib/abyss/abyss-fixmate
./usr/lib/abyss/abyss-fixmate-ssq
./usr/lib/abyss/abyss-gapfill
./usr/lib/abyss/abyss-gc
./usr/lib/abyss/abyss-index
./usr/lib/abyss/abyss-junction
./usr/lib/abyss/abyss-kaligner
./usr/lib/abyss/abyss-layout
./usr/lib/abyss/abyss-longseqdist
./usr/lib/abyss/abyss-map
./usr/lib/abyss/abyss-map-ssq
./usr/lib/abyss/abyss-mergepairs
./usr/lib/abyss/abyss-overlap
./usr/lib/abyss/abyss-paired-dbg
./usr/lib/abyss/abyss-paired-dbg-mpi
./usr/lib/abyss/abyss-pe
... and 28 more