معرفی شرکت ها

mira-assembler_4.9.6-3build2_i386.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Whole Genome Shotgun and EST Sequence Assembler
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe i386
نام بسته mira-assembler
نام فایل بسته mira-assembler_4.9.6-3build2_i386.deb
نسخه بسته 4.9.6
انتشار بسته 3build2
معماری بسته i386
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://chevreux.org/projects_mira.html
مجوز -
حجم دانلود 2197788
حجم نصب 7311
The mira genome fragment assembler is a specialised assembler for sequencing projects classified as 'hard' due to high number of similar repeats. For expressed sequence tags (ESTs) transcripts, miraEST is specialised on reconstructing pristine mRNA transcripts while detecting and classifying single nucleotide polymorphisms (SNP) occurring in different variations thereof. . The assembler is routinely used for such various tasks as mutation detection in different cell types, similarity analysis of transcripts between organisms, and pristine assembly of sequences from various sources for oligo design in clinical microarray experiments. . The package provides the following executables: Binaries provided: * mira: for assembly of genome sequences * miramem: estimating memory needed to assemble projects. * mirabait: a "grep" like tool to select reads with kmers up to 256 bases. * miraconvert: is a tool to convert, extract and sometimes recalculate all kinds of data related to sequence assembly files.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
mira-assembler_4.9.6-3build2_amd64.deb 4.9.6 amd64 Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
- libboost-filesystem1.65.1
- libboost-regex1.65.1
- libboost-system1.65.1
- libboost-thread1.65.1
>= 2.4 libc6
>= 2.0.1 libexpat1
>= 1:4.2 libgcc1
>= 4.9 libgomp1
>= 5.2 libstdc++6
>= 1:1.2.6 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb mira-assembler:

    sudo apt-get install mira-assembler_4.9.6-3build2_i386.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/mira
./usr/share/doc/mira-assembler/HELP_WANTED
./usr/share/doc/mira-assembler/NEWS.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/README
./usr/share/doc/mira-assembler/README.test
./usr/share/doc/mira-assembler/THANKS
./usr/share/doc/mira-assembler/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/copyright
./usr/share/doc/mira-assembler/est_assembly.conf
./usr/share/doc/mira-assembler/run-unit-test
./usr/share/doc/mira-assembler/solexa1.conf
./usr/share/doc/mira-assembler/solexa2.conf
./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/fasta_estset1/tvc_mini.fasta.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/fasta_estset1/tvc_mini.fasta.qual.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_backbone_in.gbf.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_in.solexa.fasta.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_in.solexa.fasta.qual.gz
./usr/share/doc/mira-assembler/test_data/solexa_eco_art/ecoli_straindata_in.txt.gz
./usr/share/lintian/overrides/mira-assembler
./usr/share/man/man1/mira.1.gz
./usr/share/man/man1/mirabait.1.gz
./usr/share/man/man1/miraconvert.1.gz
./usr/share/man/man1/miradiff.1.gz
./usr/share/man/man1/miramem.1.gz
./usr/share/man/man1/miramer.1.gz
./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/GTAGDB
./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/README
./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/consedrc.13.0
./usr/share/mira/support_3rdparty_tools/consedtaglib.txt
./usr/bin/mirabait -> mira
./usr/bin/miraconvert -> mira
./usr/bin/miramem -> mira
./usr/bin/miramer -> mira