معرفی شرکت ها

spades_3.11.1+dfsg-1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

genome assembler for single-cell and isolates data sets
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته spades
نام فایل بسته spades_3.11.1+dfsg-1_amd64.deb
نسخه بسته 3.11.1+dfsg
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://cab.spbu.ru/software/spades/
مجوز -
حجم دانلود 3761984
حجم نصب 17287
The SPAdes – St. Petersburg genome assembler is intended for both standard isolates and single-cell MDA bacteria assemblies. It works with Illumina or IonTorrent reads and is capable of providing hybrid assemblies using PacBio and Sanger reads. You can also provide additional contigs that will be used as long reads.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.15 libc6
>= 1:4.0 libgcc1
>= 4.9 libgomp1
- libhat-trie0
>= 2.1.1 libjemalloc1
>= 2.2.4 libnlopt0
- libssw0
>= 6 libstdc++6
>= 1:1.2.3.3 zlib1g
- python
- python-joblib
- python-yaml
- bwa
- bamtools
- samtools


نحوه نصب


نصب پکیج deb spades:

    sudo apt-get install spades_3.11.1+dfsg-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/spades
./usr/lib/spades/bin/corrector
./usr/lib/spades/bin/dipspades
./usr/lib/spades/bin/dipspades.py
./usr/lib/spades/bin/hammer
./usr/lib/spades/bin/ionhammer
./usr/lib/spades/bin/metaspades.py
./usr/lib/spades/bin/plasmidspades.py
./usr/lib/spades/bin/rnaspades.py
./usr/lib/spades/bin/scaffold_correction
./usr/lib/spades/bin/spades
./usr/lib/spades/bin/spades.py
./usr/lib/spades/bin/spades_init.py
./usr/lib/spades/bin/truspades.py
./usr/share/doc/spades/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/spades/copyright
./usr/share/doc/spades/dipspades_manual.html
./usr/share/doc/spades/manual.html
./usr/share/doc/spades/rnaspades_manual.html
./usr/share/doc/spades/truspades_manual.html
./usr/share/doc-base/dipspades
./usr/share/doc-base/spades
./usr/share/man/man1/dipspades.1.gz
./usr/share/man/man1/metaspades.1.gz
./usr/share/man/man1/plasmidspades.1.gz
./usr/share/man/man1/rnaspades.1.gz
./usr/share/man/man1/spades.1.gz
./usr/share/man/man1/truspades.1.gz
./usr/share/python/runtime.d/spades.rtupdate
./usr/share/spades/VERSION
./usr/share/spades/configs/corrector/corrector.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/careful_mda_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/careful_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/config.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/construction.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/detail_info_printer.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/diploid_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/distance_estimation.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/large_genome_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/mda_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/meta_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/moleculo_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/pe_params.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/plasmid_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/rna_fast_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/rna_mode.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/simplification.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/toy.info
./usr/share/spades/configs/debruijn/tsa.info
./usr/share/spades/configs/dipspades/config.info
... and 60 more