معرفی شرکت ها
r-bioc-shortread_1.36.0-1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Bionic-18.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | r-bioc-shortread |
| نام فایل بسته | r-bioc-shortread_1.36.0-1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.36.0 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/ShortRead/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 4296188 |
| حجم نصب | 6090 |
This BioConductor module is a package for input, quality assessment,
manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is
provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access
to additional facilities for advanced statistical analysis, data
transformation, visualization and integration with diverse genomic
resources.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-shortread_1.36.0-1_i386.deb | 1.36.0 | i386 | Ubuntu universe |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3.4.2-1ubuntu4 | r-base-core |
| - | r-api-3.4 |
| >= 0.23.3 | r-bioc-biocgenerics |
| - | r-bioc-biocparallel |
| >= 2.37.1 | r-bioc-biostrings |
| >= 1.21.4 | r-bioc-rsamtools |
| >= 1.5.4 | r-bioc-genomicalignments |
| - | r-bioc-biobase |
| >= 0.13.8 | r-bioc-s4vectors |
| >= 2.3.7 | r-bioc-iranges |
| >= 1.1.19 | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 1.21.6 | r-bioc-genomicranges |
| - | r-cran-hwriter |
| - | r-cran-lattice |
| - | r-cran-latticeextra |
| >= 2.14 | libc6 |
| >= 1:3.0 | libgcc1 |
| >= 5.2 | libstdc++6 |
| >= 1:1.1.4 | zlib1g |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-shortread:
sudo apt-get install r-bioc-shortread_1.36.0-1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/CITATION |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/R/ShortRead |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/R/ShortRead.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/R/ShortRead.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/Overview.R |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/Overview.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/Overview.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/GERALD/s_1_sequence.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/GERALD/s_2_export.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/GERALD/s_5_0001_realign.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/s_1_0001_prb.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/s_1_0001_seq.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/Bustard/s_1_1_0001_qseq.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/s_1_0001_int.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/Data/C1-36Firecrest/s_1_0001_nse.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/E-MTAB-1147/ERR127302_1_subset.fastq.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/E-MTAB-1147/ERR127302_2_subset.fastq.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/bowtie/s_1_aligned_bowtie.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/maq/out.aln.1.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/extdata/maq/out.aln.2.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/AnIndex |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/ShortRead.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/ShortRead.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/aliases.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/help/paths.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/html/00Index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/html/R.css |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/libs/ShortRead.so |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/script/qa-test.R |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/0000-Header.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/1000-Overview.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/1100-Overview-SolexaRealign.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/2000-RunSummary.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/3000-ReadDistribution.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/4000-CycleSpecific.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/5000-PerTile.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/6000-Alignment.html |
| ./usr/lib/R/site-library/ShortRead/template/7000-MultipleAlignment.html |
| ... and 64 more |