معرفی شرکت ها
r-bioc-rsamtools_1.30.0-1_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Bionic-18.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | r-bioc-rsamtools |
| نام فایل بسته | r-bioc-rsamtools_1.30.0-1_amd64.deb |
| نسخه بسته | 1.30.0 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://bioconductor.org/packages/Rsamtools/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 3318156 |
| حجم نصب | 5334 |
This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and
'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map),
binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix)
files.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| r-bioc-rsamtools_1.30.0-1_i386.deb | 1.30.0 | i386 | Ubuntu universe |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3.4.2-1ubuntu4 | r-base-core |
| - | r-api-3.4 |
| >= 1.1.3 | r-bioc-genomeinfodb |
| >= 1.21.6 | r-bioc-genomicranges |
| >= 2.37.1 | r-bioc-biostrings |
| >= 0.1.3 | r-bioc-biocgenerics |
| >= 0.13.8 | r-bioc-s4vectors |
| >= 2.3.7 | r-bioc-iranges |
| >= 0.15.1 | r-bioc-xvector |
| - | r-cran-bitops |
| - | r-bioc-biocparallel |
| >= 2.15 | libc6 |
| >= 1:3.0 | libgcc1 |
| >= 5.2 | libstdc++6 |
| >= 1:1.2.3.3 | zlib1g |
نحوه نصب
نصب پکیج deb r-bioc-rsamtools:
sudo apt-get install r-bioc-rsamtools_1.30.0-1_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/DESCRIPTION |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/INDEX |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/Rd.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/features.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/hsearch.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/links.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/nsInfo.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/package.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/Meta/vignette.rds |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/NAMESPACE |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/NEWS |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/R/Rsamtools |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/R/Rsamtools.rdb |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/R/Rsamtools.rdx |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/Rsamtools-Overview.R |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/Rsamtools-Overview.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/Rsamtools-Overview.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/Rsamtools-UsingCLibraries.R |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/Rsamtools-UsingCLibraries.Rnw |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/Rsamtools-UsingCLibraries.pdf |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/doc/index.html |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ce2dict1.fa |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ce2dict1.fa.fai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ex1.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ex1.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ex1.bcf |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ex1.bcf.bci |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/ex1.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/example.gtf.gz |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/example.gtf.gz.tbi |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/example_from_SAM_Spec.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/example_from_SAM_Spec.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/example_from_SAM_Spec.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/no_which_buffered_pileup.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/no_which_buffered_pileup.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/no_which_buffered_pileup.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/no_which_whole_file.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/no_which_whole_file.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/no_which_whole_file.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/olaps.Rda |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/pileup.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/querybins.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/querybins.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/querybins.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/revbins.bam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/revbins.bam.bai |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/revbins.sam |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/samtools-github.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/slxMaq09_urls.txt |
| ./usr/lib/R/site-library/Rsamtools/extdata/tagfilter.bam |
| ... and 82 more |