معرفی شرکت ها


pdb2pqr_2.1.1+dfsg-2_amd64.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Preparation of protein structures for electrostatics calculations
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته pdb2pqr
نام فایل بسته pdb2pqr_2.1.1+dfsg-2_amd64.deb
نسخه بسته 2.1.1+dfsg
انتشار بسته 2
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://pdb2pqr.poissonboltzmann.org/pdb2pqr/
مجوز -
حجم دانلود 374840
حجم نصب 2812
PDB2PQR is a Python software package that automates many of the common tasks of preparing structures for continuum electrostatics calculations. It thus provides a platform-independent utility for converting protein files in PDB format to PQR format. These tasks include: * Adding a limited number of missing heavy atoms to biomolecular structures * Determining side-chain pKas * Placing missing hydrogens * Optimizing the protein for favorable hydrogen bonding * Assigning charge and radius parameters from a variety of force fields . This package also includes PropKa, a tool to modify the protonation state of protein structures in the Protein Data Bank (PDB) format to match a given pKa value. It can also be used to refine NMR structures, which often yield inaccurate pKa values for some residues.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
pdb2pqr-doc_2.1.1+dfsg-2_all.deb 2.1.1+dfsg all Ubuntu universe
pdb2pqr_2.1.1+dfsg-2_i386.deb 2.1.1+dfsg i386 Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.14 libc6
>= 1:3.0 libgcc1
>= 2.7 libpython2.7
>= 5.2 libstdc++6
>= 2.6.6-7~ python:any
- python2.7:any
- python-numpy
- python-networkx


نحوه نصب


نصب پکیج deb pdb2pqr:

    sudo apt-get install pdb2pqr_2.1.1+dfsg-2_amd64.deb