معرفی شرکت ها
macs_2.1.1.20160309-2_amd64.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Bionic-18.04 |
| مخزن | Ubuntu universe amd64 |
| نام بسته | macs |
| نام فایل بسته | macs_2.1.1.20160309-2_amd64.deb |
| نسخه بسته | 2.1.1.20160309 |
| انتشار بسته | 2 |
| معماری بسته | amd64 |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://github.com/taoliu/MACS/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 2474456 |
| حجم نصب | 5512 |
MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which
tends to be shorter than sonication or library construction size estimates,
and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites.
MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local
biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust
prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding
algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq
with or without control samples.
جایگزین ها
| بسته | نسخه | معماری | مخزن |
|---|---|---|---|
| macs_2.1.1.20160309-2_i386.deb | 2.1.1.20160309 | i386 | Ubuntu universe |
| macsyfinder_1.0.5-1_all.deb | 1.0.5 | all | Ubuntu universe |
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | cython |
| << 2.8 | python |
| >= 2.7~ | python |
| - | python-numpy |
| << 2.8 | python:any |
| >= 2.7.5-5~ | python:any |
| >= 2.15 | libc6 |
نحوه نصب
نصب پکیج deb macs:
sudo apt-get install macs_2.1.1.20160309-2_amd64.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/macs2 |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/Constants.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/BedGraph.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/BedGraphIO.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/BinKeeper.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/CallPeakUnit.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/FixWidthTrack.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/PairedEndTrack.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/Parser.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/PeakIO.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/ScoreTrack.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/__init__.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/test_processing.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/IO/test_threading.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/OptValidator.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/OutputWriter.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/PeakDetect.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/PeakModel.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/Pileup.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/Prob.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/Signal.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/Statistics.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/__init__.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/bdgbroadcall_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/bdgcmp_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/bdgdiff_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/bdgopt_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/bdgpeakcall_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/callpeak_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/cmbreps_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/data/__init__.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/data/g0.01.dat |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/data/g0.05.dat |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/diffpeak_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/filterdup_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/hashtable.x86_64-linux-gnu.so |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/pileup_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/predictd_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/randsample_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2/refinepeak_cmd.py |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2-2.1.1.20160309.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2-2.1.1.20160309.egg-info/dependency_links.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2-2.1.1.20160309.egg-info/requires.txt |
| ./usr/lib/python2.7/dist-packages/MACS2-2.1.1.20160309.egg-info/top_level.txt |
| ./usr/share/doc/macs/README.rst.gz |
| ./usr/share/doc/macs/README.test |
| ./usr/share/doc/macs/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/macs/copyright |
| ./usr/share/doc/macs/examples/aluY.chr1.bed.gz |
| ./usr/share/doc/macs/examples/gerp.chr1.bed.gz |
| ... and 16 more |