معرفی شرکت ها

libvcflib-tools_1.0.0~rc1+dfsg1-6_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته libvcflib-tools
نام فایل بسته libvcflib-tools_1.0.0~rc1+dfsg1-6_amd64.deb
نسخه بسته 1.0.0~rc1+dfsg1
انتشار بسته 6
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/ekg/vcflib
مجوز -
حجم دانلود 637172
حجم نصب 3936
The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors. . vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both: . * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can be described by the VCF format, * and a collection of command-line utilities for executing complex manipulations on VCF files. . This package contains several tools using the library.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.23 libc6
>= 0.0.2 libdisorder0
- libfastahack0
>= 1:3.0 libgcc1
>= 4.9 libgomp1
- libsmithwaterman0
>= 5.2 libstdc++6
- libtabixpp0
- libvcflib1


نحوه نصب


نصب پکیج deb libvcflib-tools:

    sudo apt-get install libvcflib-tools_1.0.0~rc1+dfsg1-6_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/vcflib
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotBfst.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotHapLrt.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotHaplotypes.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotPfst.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotSmoothed.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotWCfst.R
./usr/lib/R/site-library/vcflib/plotXPEHH.R
./usr/lib/vcflib/bin/LD
./usr/lib/vcflib/bin/abba-baba
./usr/lib/vcflib/bin/bFst
./usr/lib/vcflib/bin/dumpContigsFromHeader
./usr/lib/vcflib/bin/genotypeSummary
./usr/lib/vcflib/bin/hapLrt
./usr/lib/vcflib/bin/iHS
./usr/lib/vcflib/bin/meltEHH
./usr/lib/vcflib/bin/normalize-iHS
./usr/lib/vcflib/bin/pFst
./usr/lib/vcflib/bin/permuteGPAT++
./usr/lib/vcflib/bin/permuteSmooth
./usr/lib/vcflib/bin/plotHaps
./usr/lib/vcflib/bin/popStats
./usr/lib/vcflib/bin/segmentFst
./usr/lib/vcflib/bin/segmentIhs
./usr/lib/vcflib/bin/sequenceDiversity
./usr/lib/vcflib/bin/smoother
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2dag
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2fasta
./usr/lib/vcflib/bin/vcf2tsv
./usr/lib/vcflib/bin/vcfaddinfo
./usr/lib/vcflib/bin/vcfafpath
./usr/lib/vcflib/bin/vcfallelicprimitives
./usr/lib/vcflib/bin/vcfaltcount
./usr/lib/vcflib/bin/vcfannotate
./usr/lib/vcflib/bin/vcfannotategenotypes
./usr/lib/vcflib/bin/vcfbreakmulti
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcat
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcheck
./usr/lib/vcflib/bin/vcfclassify
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcleancomplex
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcombine
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcommonsamples
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcountalleles
./usr/lib/vcflib/bin/vcfcreatemulti
./usr/lib/vcflib/bin/vcfdistance
./usr/lib/vcflib/bin/vcfecho
./usr/lib/vcflib/bin/vcfentropy
./usr/lib/vcflib/bin/vcfevenregions
./usr/lib/vcflib/bin/vcffilter
./usr/lib/vcflib/bin/vcffixup
... and 46 more