معرفی شرکت ها

fitgcp_0.0.20150429-1_amd64.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

fitting genome coverage distributions with mixture models
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe amd64
نام بسته fitgcp
نام فایل بسته fitgcp_0.0.20150429-1_amd64.deb
نسخه بسته 0.0.20150429
انتشار بسته 1
معماری بسته amd64
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://sourceforge.net/projects/fitgcp/
مجوز -
حجم دانلود 12316
حجم نصب 50
Genome coverage, the number of sequencing reads mapped to a position in a genome, is an insightful indicator of irregularities within sequencing experiments. While the average genome coverage is frequently used within algorithms in computational genomics, the complete information available in coverage profiles (i.e. histograms over all coverages) is currently not exploited to its full extent. Thus, biases such as fragmented or erroneous reference genomes often remain unaccounted for. Making this information accessible can improve the quality of sequencing experiments and quantitative analyses. . fitGCP is a framework for fitting mixtures of probability distributions to genome coverage profiles. Besides commonly used distributions, fitGCP uses distributions tailored to account for common artifacts. The mixture models are iteratively fitted based on the Expectation-Maximization algorithm.


نیازمندی

مقدار نام
>= 2.6.6-7~ python:any
- python-scipy
- python-numpy
- python-pysam


نحوه نصب


نصب پکیج deb fitgcp:

    sudo apt-get install fitgcp_0.0.20150429-1_amd64.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/share/doc/fitgcp/README.txt
./usr/share/doc/fitgcp/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/fitgcp/copyright
./usr/share/fitgcp/fitGCP.py
./usr/share/man/man1/fitgcp.1.gz
./usr/share/python/runtime.d/fitgcp.rtupdate
./usr/bin/fitgcp -> ../share/fitgcp/fitGCP.py