معرفی شرکت ها

wigeon_20101212+dfsg1-1build1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

reimplementation of the Pintail 16S DNA anomaly detection utility
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته wigeon
نام فایل بسته wigeon_20101212+dfsg1-1build1_all.deb
نسخه بسته 20101212+dfsg1
انتشار بسته 1build1
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://microbiomeutil.sourceforge.net/
مجوز -
حجم دانلود 27816
حجم نصب 168
WigeoN examines the sequence conservation between a query and a trusted reference sequence, both in NAST alignment format. Based on the sequence identity between the query and the reference sequence, there is an expected amount of variation among the alignment. If the observed variation is greater than the 95% quantile of the distribution of variation observed between non-anomalous sequences, then it is flagged as an anomaly. . WigeoN is a flexible command-line based reimplementation of the Pintail algorithm Appl Environ Microbiol. 2005 Dec;7112:7724-36. . WigeoN is useful for flagging chimeras and anomalies only in near full-length 16S rRNA sequences. WigeoN lacks sensitivity with sequences less than 1000 bp. . To run WigeoN, you need NAST-formatted sequences generated by the nast-ier utility. . WigeoN is part of the microbiomeutil suite.


نیازمندی

مقدار نام
- microbiomeutil-data


نحوه نصب


نصب پکیج deb wigeon:

    sudo apt-get install wigeon_20101212+dfsg1-1build1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/WigeoN/PerlLib/BHStats.pm
./usr/lib/WigeoN/PerlLib/CdbTools.pm
./usr/lib/WigeoN/PerlLib/Fasta_reader.pm
./usr/lib/WigeoN/README
./usr/lib/WigeoN/WigeoN.pl
./usr/lib/WigeoN/data/DE_quantiles.dat
./usr/lib/WigeoN/data/eco.prokMSA
./usr/lib/WigeoN/data/rRNA16S.gold.NAST_ALIGNED.fasta.cons
./usr/lib/WigeoN/run_CM_to_WigeoN.pl
./usr/lib/WigeoN/run_WigeoN.pl
./usr/lib/WigeoN/util/all_vs_all_WigeoN.pl
./usr/lib/WigeoN/util/apply_eco_Mask.pl
./usr/lib/WigeoN/util/compute_quant_bins.pl
./usr/lib/WigeoN/util/eco.prokMSA
./usr/lib/WigeoN/util/eco_nast_freq.pl
./usr/lib/WigeoN/util/makeConservationProfile.pl
./usr/lib/WigeoN/util/smooth.pl
./usr/share/doc/wigeon/README
./usr/share/doc/wigeon/copyright
./usr/share/man/man1/cm_to_wigeon.1.gz
./usr/share/man/man1/wigeon.1.gz
./usr/bin/cm_to_wigeon -> ../lib/WigeoN/run_CM_to_WigeoN.pl
./usr/bin/wigeon -> ../lib/WigeoN/run_WigeoN.pl
./usr/share/doc/wigeon/changelog.Debian.gz -> ../microbiomeutil-data/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/wigeon/examples -> ../microbiomeutil-data/examples/WigeoN