معرفی شرکت ها

sspace_2.1.1+dfsg-3_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

scaffolding pre-assembled contigs after extension
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته sspace
نام فایل بسته sspace_2.1.1+dfsg-3_all.deb
نسخه بسته 2.1.1+dfsg
انتشار بسته 3
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/nsoranzo/sspace_basic
مجوز -
حجم دانلود 1339564
حجم نصب 1445
SSAKE-based Scaffolding of Pre-Assembled Contigs after Extension (SSPACE) is a script able to extend and scaffold pre-assembled contigs using one or more mate pairs or paired-end libraries, or even a combination. . SSPACE is built based on SSAKE. Code of SSAKE is changed to be able to extend and scaffold pre-assembled contigs for multiple paired reads libraries. . This is the free 'basic' version of SSPACE. The non-free 'standard' version is available directly from Baseclear.


نیازمندی

مقدار نام
- perl:any
- python
- bowtie


نحوه نصب


نصب پکیج deb sspace:

    sudo apt-get install sspace_2.1.1+dfsg-3_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/sspace
./usr/share/doc/sspace/README.Debian
./usr/share/doc/sspace/README.gz
./usr/share/doc/sspace/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/sspace/copyright
./usr/share/doc/sspace/examples/contigs_abyss.fasta.gz
./usr/share/doc/sspace/examples/libraries.txt
./usr/share/man/man1/sspace.1.gz
./usr/share/sspace/SSPACE_Basic.pl
./usr/share/sspace/bin/ExtendOrFormatContigs.pl
./usr/share/sspace/bin/PairingAndScaffolding.pl
./usr/share/sspace/bin/readLibFiles.pl
./usr/share/sspace/dotlib/DotLib.pm
./usr/share/sspace/tools/TQS.py
./usr/share/sspace/tools/TQS.readme
./usr/share/sspace/tools/TQSexport.py
./usr/share/sspace/tools/TQSfastq.py
./usr/share/sspace/tools/TRIMMING_PAIRED_READS.README
./usr/share/sspace/tools/estimate_insert_size.pl
./usr/share/sspace/tools/fq_all2std.pl
./usr/share/sspace/tools/qseq2fasta.pl
./usr/share/sspace/tools/qseq2fastq.pl
./usr/share/sspace/tools/sam_bam2tab.pl
./usr/share/sspace/SSPACE_Basic_v2.0.pl -> SSPACE_Basic.pl