معرفی شرکت ها

ruby-crb-blast_0.6.9-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Run conditional reciprocal best blast
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته ruby-crb-blast
نام فایل بسته ruby-crb-blast_0.6.9-1_all.deb
نسخه بسته 0.6.9
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/cboursnell/crb-blast
مجوز -
حجم دانلود 11580
حجم نصب 51
CRB-BLAST is a novel method for finding orthologs between one set of sequences and another. This is particularly useful in genome and transcriptome annotation. . CRB-BLAST initially performs a standard reciprocal best BLAST. It does this by performing BLAST alignments of query->target and target->query. Reciprocal best BLAST hits are those where the best match for any given query sequence in the query->target alignment is also the best hit of the match in the reverse (target->query) alignment. . Reciprocal best BLAST is a very conservative way to assign orthologs. The main innovation in CRB-BLAST is to learn an appropriate e-value cutoff to apply to each pairwise alignment by taking into account the overall relatedness of the two datasets being compared. This is done by fitting a function to the distribution of alignment e-values over sequence lengths. The function provides the e-value cutoff for a sequence of given length.


نیازمندی

مقدار نام
- ncbi-blast+
- ruby | ruby-interpreter
- ruby-bio
- ruby-fixwhich
- ruby-threach
>= 2.0 ruby-trollop


نحوه نصب


نصب پکیج deb ruby-crb-blast:

    sudo apt-get install ruby-crb-blast_0.6.9-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/crb-blast
./usr/lib/ruby/vendor_ruby/crb-blast/cmd.rb
./usr/lib/ruby/vendor_ruby/crb-blast/crb-blast.rb
./usr/lib/ruby/vendor_ruby/crb-blast/hit.rb
./usr/lib/ruby/vendor_ruby/crb-blast/version.rb
./usr/lib/ruby/vendor_ruby/crb-blast.rb
./usr/share/doc/ruby-crb-blast/README.md.gz
./usr/share/doc/ruby-crb-blast/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/ruby-crb-blast/copyright
./usr/share/man/man1/crb-blast.1.gz
./usr/share/rubygems-integration/all/specifications/crb-blast-0.6.9.gemspec