معرفی شرکت ها


python-pbcore_1.2.11+dfsg-1ubuntu1_all.deb


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Python library for processing PacBio data files
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته python-pbcore
نام فایل بسته python-pbcore_1.2.11+dfsg-1ubuntu1_all.deb
نسخه بسته 1.2.11+dfsg
انتشار بسته 1ubuntu1
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/PacificBiosciences/pbcore
مجوز -
حجم دانلود 9083832
حجم نصب 16975
The pbcore package provides Python modules for processing Pacific Biosciences data files and building PacBio bioinformatics applications. These modules include tools to read/write PacBio data formats, sample data files for testing and debugging, base classes, and utilities for building bioinformatics applications. . This package is part of the SMRTAnalysis suite.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
python-pbcore-doc_1.2.11+dfsg-1ubuntu1_all.deb 1.2.11+dfsg all Ubuntu universe


نیازمندی

مقدار نام
- python-h5py
- python-numpy
- python-pysam
<< 2.8 python:any
>= 2.7.5-5~ python:any
- python-pkg-resources


نحوه نصب


نصب پکیج deb python-pbcore:

    sudo apt-get install python-pbcore_1.2.11+dfsg-1ubuntu1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/bin/pbopen
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/chemistry/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/chemistry/chemistry.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/chemistry/resources/mapping.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/1.4_bas_files.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/2.0_bax_files.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/2.1_bax_files.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/2.1_ccs_files.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/2.3_bax_files.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/Fluidigm_human_amplicons.fasta
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/Fluidigm_human_amplicons.fasta.fai
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/Fluidigm_human_amplicons_tiny.fasta
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/aligned_reads_1.cmp.h5
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/barcodes-ed65-450.fasta
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/barcodes-ed65-450.fasta.fai
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/bc_files.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/blasr-output.m4
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/blasr-output.m5
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/alignment.dataset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/barcode.dataset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/ccsaligned.dataset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/ccsread.dataset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/contig.dataset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/empty_lambda.aligned.bam
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/empty_lambda.aligned.bam.bai
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/empty_lambda.aligned.bam.pbi
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/fofn.fofn
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/hdfsubread_dataset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/lambda.alignmentset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/lambda.referenceset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/m140905_042212_sidney_c100564852550000001823085912221377_s1_X0.subreads.fake_bc.bam
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/m140905_042212_sidney_c100564852550000001823085912221377_s1_X0.subreads.fake_bc.bam.bai
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/m140905_042212_sidney_c100564852550000001823085912221377_s1_X0.subreads.fake_bc.bam.pbi
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/m150430_142051_Mon_p1_b25.sts.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/m150616_053259_ethan_c100710482550000001823136404221563_s1_p0.sts.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim.alignmentset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim.hdfsubreadset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.alignmentset.chunk0contigs.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.alignmentset.chunk1contigs.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.alignmentset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.bas.h5
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.hdfsubreadset.xml
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.pbalign.bam
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.pbalign.bam.bai
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.pbalign.bam.pbi
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.reference.fasta
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbcore/data/datasets/pbalchemysim0.reference.fasta.fai
... and 114 more