معرفی شرکت ها

python-pbalign_0.3.0-1_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته python-pbalign
نام فایل بسته python-pbalign_0.3.0-1_all.deb
نسخه بسته 0.3.0
انتشار بسته 1
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com/PacificBiosciences/pbalign
مجوز -
حجم دانلود 37196
حجم نصب 225
pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format. . pbalign is part of the SMRTAnalysis suite. This package provides the Python library backend.


نیازمندی

مقدار نام
- python-pbcommand
- python-pbcore
- python-pysam
<< 2.8 python:any
>= 2.7.5-5~ python:any
>= 5.3+0 blasr


نحوه نصب


نصب پکیج deb python-pbalign:

    sudo apt-get install python-pbalign_0.3.0-1_all.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/alignservice/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/alignservice/align.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/alignservice/blasr.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/alignservice/bowtie.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/alignservice/fastabasedalign.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/alignservice/gmap.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/bampostservice.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/ccs.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/filterservice.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/options.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/pbalignfiles.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/pbalignrunner.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/service.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tasks/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tasks/consolidate_alignments.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tools/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tools/createChemistryHeader.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tools/extractUnmappedSubreads.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tools/loadChemistry.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/tools/mask_aligned_reads.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/utils/RgnH5IO.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/utils/__init__.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/utils/fileutil.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/utils/progutil.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign/utils/tempfileutil.py
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign-0.3.0.egg-info/PKG-INFO
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign-0.3.0.egg-info/dependency_links.txt
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign-0.3.0.egg-info/entry_points.txt
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign-0.3.0.egg-info/not-zip-safe
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign-0.3.0.egg-info/requires.txt
./usr/lib/python2.7/dist-packages/pbalign-0.3.0.egg-info/top_level.txt
./usr/share/doc/python-pbalign/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/python-pbalign/copyright