معرفی شرکت ها

jmodeltest_2.1.10+dfsg-5_all.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

HPC selection of models of nucleotide substitution
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu universe all
نام بسته jmodeltest
نام فایل بسته jmodeltest_2.1.10+dfsg-5_all.deb
نسخه بسته 2.1.10+dfsg
انتشار بسته 5
معماری بسته all
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی https://github.com//ddarriba/jmodeltest2
مجوز -
حجم دانلود 977468
حجم نصب 2678
jModelTest is a tool to carry out statistical selection of best-fit models of nucleotide substitution. It implements five different model selection strategies: hierarchical and dynamical likelihood ratio tests (hLRT and dLRT), Akaike and Bayesian information criteria (AIC and BIC), and a decision theory method (DT). It also provides estimates of model selection uncertainty, parameter importances and model-averaged parameter estimates, including model-averaged tree topologies. jModelTest 2 includes High Performance Computing (HPC) capabilities and additional features like new strategies for tree optimization, model- averaged phylogenetic trees (both topology and branch length), heuristic filtering and automatic logging of user activity.


نیازمندی

مقدار نام
- alter-sequence-alignment
- libmpj-java
- libpal-java


نحوه نصب


نصب پکیج deb jmodeltest:

    sudo apt-get install jmodeltest_2.1.10+dfsg-5_all.deb


فایل ها

مسیرها
./etc/jmodeltest/jmodeltest.conf
./usr/bin/runjmodeltest-cluster
./usr/bin/runjmodeltest-gui
./usr/share/doc/jmodeltest/README.gz
./usr/share/doc/jmodeltest/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/jmodeltest/copyright
./usr/share/doc/jmodeltest/manual.pdf
./usr/share/doc-base/jmodeltest
./usr/share/jmodeltest/example-data/18S_insects2.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/Birds.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/HIV_vpu.ref2.fas
./usr/share/jmodeltest/example-data/HIVpol.groupM.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/Hex_EF1a.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/aP6.fas
./usr/share/jmodeltest/example-data/aP6.phy
./usr/share/jmodeltest/example-data/channa.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/data.phy
./usr/share/jmodeltest/example-data/example.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/gusanos16S.mafft.fas
./usr/share/jmodeltest/example-data/gusanosCOI.mafft.fas
./usr/share/jmodeltest/example-data/primate-mtDNA.nex
./usr/share/jmodeltest/example-data/rodents.nex
./usr/share/jmodeltest/extra/filecluster8.conf.template
./usr/share/jmodeltest/extra/machines
./usr/share/jmodeltest/jModelTest.jar
./usr/share/jmodeltest/resources/template/index.html
./usr/share/jmodeltest/resources/template/resources/homeIcon.gif
./usr/share/jmodeltest/resources/template/resources/logo0.png
./usr/share/jmodeltest/resources/template/resources/style.css
./usr/share/jmodeltest/resources/template/resources/topIcon.gif
./usr/share/jmodeltest/trees/aP6.tree
./usr/share/jmodeltest/trees/aP6b.tree
./usr/share/man/man1/runjmodeltest-gui.1.gz
./usr/bin/jmodeltest -> runjmodeltest-gui
./usr/share/java/jmodeltest.jar -> ../jmodeltest/jModelTest.jar
./usr/share/jmodeltest/conf -> /etc/jmodeltest
./usr/share/jmodeltest/log -> /var/log/jmodeltest
./usr/share/man/man1/jmodeltest.1.gz -> runjmodeltest-gui.1.gz