معرفی شرکت ها
fastqc_0.11.5+dfsg-6_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
quality control for high throughput sequence data
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Bionic-18.04 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | fastqc |
| نام فایل بسته | fastqc_0.11.5+dfsg-6_all.deb |
| نسخه بسته | 0.11.5+dfsg |
| انتشار بسته | 6 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 354202 |
| حجم نصب | 536 |
FastQC aims to provide a simple way to do some quality control checks on
raw sequence data coming from high throughput sequencing pipelines. It
provides a modular set of analyses which you can use to give a quick
impression of whether your data has any problems of which you should
be aware before doing any further analysis.
.
The main functions of FastQC are
* Import of data from BAM, SAM or FastQ files (any variant)
* Providing a quick overview to tell you in which areas there may
be problems
* Summary graphs and tables to quickly assess your data
* Export of results to an HTML based permanent report
* Offline operation to allow automated generation of reports without
running the interactive application
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | libcommons-math3-java |
| - | libjbzip2-java |
| - | libhtsjdk-java |
| - | default-jre | java7-runtime |
نحوه نصب
نصب پکیج deb fastqc:
sudo apt-get install fastqc_0.11.5+dfsg-6_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./etc/fastqc/Configuration/adapter_list.txt |
| ./etc/fastqc/Configuration/contaminant_list.txt |
| ./etc/fastqc/Configuration/limits.txt |
| ./usr/bin/fastqc |
| ./usr/share/applications/fastqc.desktop |
| ./usr/share/doc/fastqc/README.Debian |
| ./usr/share/doc/fastqc/README.txt |
| ./usr/share/doc/fastqc/changelog.Debian.gz |
| ./usr/share/doc/fastqc/copyright |
| ./usr/share/doc/fastqc/examples/example.fastq.gz |
| ./usr/share/doc/fastqc/examples/toy.bam |
| ./usr/share/doc/fastqc/examples/toy.sam |
| ./usr/share/fastqc/Help/1 Introduction/1.1 What is FastQC.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/2 Basic Operations/2.1 Opening a sequence file.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/2 Basic Operations/2.2 Evaluating Results.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/2 Basic Operations/2.3 Saving a Report.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/1 Basic Statistics.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/10 Adapter Content.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/11 Kmer Content.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/12 Per Tile Sequence Quality.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/2 Per Base Sequence Quality.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/3 Per Sequence Quality Scores.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/4 Per Base Sequence Content.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/5 Per Sequence GC Content.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/6 Per Base N Content.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/7 Sequence Length Distribution.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/8 Duplicate Sequences.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/9 Overrepresented Sequences.html |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/duplication_levels.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/kmer_profiles.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_base_gc_content.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_base_n_content.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_base_quality.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_base_sequence_content.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_sequence_gc_content.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_sequence_quality.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/per_tile_quality.png |
| ./usr/share/fastqc/Help/3 Analysis Modules/sequence_length_distribution.png |
| ./usr/share/icons/hicolor/32x32/apps/fastqc_icon.png |
| ./usr/share/java/fastqc-0.11.5.jar |
| ./usr/share/man/man1/fastqc.1.gz |
| ./usr/share/java/fastqc.jar -> fastqc-0.11.5.jar |