معرفی شرکت ها
fastaq_3.17.0-1_all.deb
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
FASTA and FASTQ file manipulation tools
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | Linux |
| توزیع | Ubuntu Bionic-18.04 |
| مخزن | Ubuntu universe all |
| نام بسته | fastaq |
| نام فایل بسته | fastaq_3.17.0-1_all.deb |
| نسخه بسته | 3.17.0 |
| انتشار بسته | 1 |
| معماری بسته | all |
| نگهدارنده | Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com> |
| تاریخ ساخت | - |
| هاست سازنده | - |
| نوع بسته | .deb |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/sanger-pathogens/Fastaq |
| مجوز | - |
| حجم دانلود | 47608 |
| حجم نصب | 195 |
Fastaq represents a diverse collection of scripts that perform useful and
common FASTA/FASTQ manipulation tasks, such as filtering, merging, splitting,
sorting, trimming, search/replace, etc. Input and output files can be gzipped
(format is automatically detected) and individual Fastaq commands can be piped
together.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >= 3.3.2-2~ | python3:any |
| - | python3-pkg-resources |
| - | samtools |
نحوه نصب
نصب پکیج deb fastaq:
sudo apt-get install fastaq_3.17.0-1_all.deb
فایل ها
| مسیرها |
|---|
| ./usr/bin/fastaq |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/caf.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/genetic_codes.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/intervals.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/__init__.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/acgtn_only.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/add_indels.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/caf_to_fastq.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/capillary_to_pairs.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/chunker.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/count_sequences.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/deinterleave.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/enumerate_names.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/expand_nucleotides.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/fasta_to_fastq.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/filter.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/get_ids.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/get_seq_flanking_gaps.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/interleave.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/make_random_contigs.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/merge.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/replace_bases.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/reverse_complement.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/scaffolds_to_contigs.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/search_for_seq.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/sequence_trim.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/sort_by_name.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/sort_by_size.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/split_by_base_count.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/strip_illumina_suffix.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_boulderio.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_fake_qual.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_fasta.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_mira_xml.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_orfs_gff.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_perfect_reads.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_random_subset.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_tiling_bam.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/to_unique_by_id.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/translate.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/trim_Ns_at_end.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/trim_contigs.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/trim_ends.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/runners/version.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/sequences.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/tasks.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq/utils.py |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq-3.17.0.egg-info/PKG-INFO |
| ./usr/lib/python3/dist-packages/pyfastaq-3.17.0.egg-info/dependency_links.txt |
| ... and 44 more |