معرفی شرکت ها

gmap_2017-11-15-1_i386.deb

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
ویژگی مقدار
سیستم عامل Linux
توزیع Ubuntu Bionic-18.04
مخزن Ubuntu multiverse i386
نام بسته gmap
نام فایل بسته gmap_2017-11-15-1_i386.deb
نسخه بسته 2017
انتشار بسته 11
معماری بسته i386
نگهدارنده Ubuntu Developers <ubuntu-devel-discuss@lists.ubuntu.com>
تاریخ ساخت -
هاست سازنده -
نوع بسته .deb
آدرس صفحه اصلی http://research-pub.gene.com/gmap
مجوز -
حجم دانلود 10839836
حجم نصب 78530
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of * known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs). GSNAP can align bisulfite-treated DNA.


جایگزین ها

بسته نسخه معماری مخزن
gmap_2017-11-15-1_amd64.deb 2017 amd64 Ubuntu multiverse


نیازمندی

مقدار نام
- perl:any
- libbz2-1.0
>= 2.11 libc6
>= 1:1.2.6 zlib1g


نحوه نصب


نصب پکیج deb gmap:

    sudo apt-get install gmap_2017-11-15-1_i386.deb


فایل ها

مسیرها
./usr/lib/gmap/atoiindex
./usr/lib/gmap/cmetindex
./usr/lib/gmap/cpuid
./usr/lib/gmap/dbsnp_iit
./usr/lib/gmap/ensembl_genes
./usr/lib/gmap/fa_coords
./usr/lib/gmap/get-genome
./usr/lib/gmap/gff3_genes
./usr/lib/gmap/gff3_introns
./usr/lib/gmap/gff3_splicesites
./usr/lib/gmap/gmap
./usr/lib/gmap/gmap.nosimd
./usr/lib/gmap/gmap_build
./usr/lib/gmap/gmap_compress
./usr/lib/gmap/gmap_process
./usr/lib/gmap/gmap_reassemble
./usr/lib/gmap/gmap_uncompress
./usr/lib/gmap/gmapindex
./usr/lib/gmap/gmapl
./usr/lib/gmap/gmapl.nosimd
./usr/lib/gmap/gsnap
./usr/lib/gmap/gsnap.nosimd
./usr/lib/gmap/gsnapl
./usr/lib/gmap/gsnapl.nosimd
./usr/lib/gmap/gtf_genes
./usr/lib/gmap/gtf_introns
./usr/lib/gmap/gtf_splicesites
./usr/lib/gmap/gtf_transcript_splicesites
./usr/lib/gmap/gvf_iit
./usr/lib/gmap/iit_dump
./usr/lib/gmap/iit_get
./usr/lib/gmap/iit_store
./usr/lib/gmap/md_coords
./usr/lib/gmap/psl_genes
./usr/lib/gmap/psl_introns
./usr/lib/gmap/psl_splicesites
./usr/lib/gmap/sam_sort
./usr/lib/gmap/snpindex
./usr/lib/gmap/uniqscan
./usr/lib/gmap/uniqscanl
./usr/lib/gmap/vcf_iit
./usr/share/doc/gmap/AUTHORS
./usr/share/doc/gmap/NOTICE.gz
./usr/share/doc/gmap/README.Debian
./usr/share/doc/gmap/README.gz
./usr/share/doc/gmap/changelog.Debian.gz
./usr/share/doc/gmap/copyright
./usr/share/lintian/overrides/gmap
./usr/share/man/man1/gmap.1.gz
./usr/share/man/man1/gmap_build.1.gz
... and 11 more