معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

دانلود نسخه باینری

توضیحات

STochastic Engine for Pathway Simulation

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	Linux
توزیع	Fedora 39
مخزن	Fedora Everything x86_64
نام بسته	python-steps
نام فایل بسته	python-steps-3.6.0-30.fc39.src.rpm
نسخه بسته	3.6.0
انتشار بسته	30.fc39
معماری بسته	x86_64
نگهدارنده	-
تاریخ ساخت	Fri 21 Jul 2023 06
هاست سازنده	buildhw-x86-04.iad2.fedoraproject.org
نوع بسته	.rpm
آدرس صفحه اصلی	http://steps.sourceforge.net/
مجوز	GPLv2
حجم دانلود	36M
حجم نصب	36.137M

STEPS is a package for exact stochastic simulation of reaction-diffusion systems in arbitrarily complex 3D geometries. Our core simulation algorithm is an implementation of Gillespie's SSA, extended to deal with diffusion of molecules over the elements of a 3D tetrahedral mesh. While it was mainly developed for simulating detailed models of neuronal signaling pathways in dendrites and around synapses, it is a general tool and can be used for studying any biochemical pathway in which spatial gradients and morphology are thought to play a role. STEPS also supports accurate and efficient computational of local membrane potentials on tetrahedral meshes, with the addition of voltage-gated channels and currents. Tight integration between the reaction-diffusion calculations and the tetrahedral mesh potentials allows detailed coupling between molecular activity and local electrical excitability. We have implemented STEPS as a set of Python modules, which means STEPS users can use Python scripts to control all aspects of setting up the model, generating a mesh, controlling the simulation and generating and analyzing output. The core computational routines are still implemented as C/C++ extension modules for maximal speed of execution. STEPS 3.0.0 and above provide early parallel solution for stochastic spatial reaction-diffusion and electric field simulation. Documentation can be found here: http://steps.sourceforge.net/manual/manual_index.html

جایگزین ها

بسته	نسخه	معماری	مخزن
python-steps-debuginfo-3.6.0-30.fc39.aarch64.rpm	3.6.0	aarch64	Fedora Everything
python-steps-debuginfo-3.6.0-30.fc39.x86_64.rpm	3.6.0	x86_64	Fedora Everything
python-steps-debugsource-3.6.0-30.fc39.aarch64.rpm	3.6.0	aarch64	Fedora Everything
python-steps-debugsource-3.6.0-30.fc39.x86_64.rpm	3.6.0	x86_64	Fedora Everything

نیازمندی

مقدار	نام
-	Random123-devel
-	cmake
-	easyloggingpp-static
-	flexiblas-devel
-	gcc-c++
-	make
-	mpich-devel
-	openmpi-devel
-	petsc-devel
-	petsc-mpich-devel
-	petsc-openmpi-devel
-	pkgconfig(easyloggingpp)
-	pkgconfig(gtest_main)
-	python3-devel
-	python3dist(cython)
-	python3dist(matplotlib)
-	python3dist(numpy)
-	python3dist(pytest)
-	python3dist(scipy)
-	python3dist(setuptools)
-	rpm-mpi-hooks

ارائه دهنده

مقدار	نام
= 3.6.0-30.fc39	python3-steps
= 3.6.0-30.fc39	python3-steps-openmpi
= 3.6.0-30.fc39	python3-steps-mpich
= 3.6.0-30.fc39	python-steps-debuginfo
= 3.6.0-30.fc39	python-steps-debugsource

نحوه نصب

نصب پکیج rpm python-steps:

dnf install python-steps-3.6.0-30.fc39.src.rpm

فایل ها

مسیرها
0001-Unbundle-gtest.patch
0001-feat-replace-nose-invocations-with-pytest.patch
0002-Make-libstepsutil-static.patch
0003-Remove-flags-set-by-project.patch
0004-Remove-pysteps-flags.patch
0005-Disable-pyinstall.patch
0007-template-matching-collections_hpp.patch
29.patch
STEPS-3.6.0.tar.gz

گزارش تغییرات

تاریخ آخرین تغییر	جزئیات
2023-07-21	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_39_Mass_Rebuild
2023-06-27	Rebuilt for Python 3.12
2023-02-03	Leaf package on ix86: drop ix86 support
2023-01-24	Rebuilt for gtest 1.13.0 (fix RHBZ#2164003) Build with C++14 instead of C++11, since gtest dropped support Add a missing #include directive for GCC 13
2023-01-24	Remove old easylogging++ sources from dist-git
2023-01-20	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_38_Mass_Rebuild
2022-09-08	Tidy up spec file formatting
2022-09-08	Stop numbering patches
2022-09-08	Unbundle easyloggingpp
2022-08-29	Improve treatment of bundled sundials(2) Unbundling currently works up to linking, where there are undefined
2022-08-29	Use more standard macros where we can
2022-08-29	Add -DCMAKE_INSTALL_DO_STRIP:BOOL=OFF to match %%cmake
2022-08-29	Use pkgconf to set unbundled gtest flags
2022-08-29	Simplify patch application
2022-08-29	Better handle bundled easyloggingpp dependency
2022-08-18	Remove unbundled dependencies in %%prep