معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

دانلود نسخه باینری دانلود نسخه سورس

توضیحات

Analyses of Phylogenetics and Evolution

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	Linux
توزیع	Fedora 38
مخزن	Fedora Everything x86_64
نام بسته	R-ape
نام فایل بسته	R-ape-5.6.2-3.fc38.x86_64.rpm
نسخه بسته	5.6.2
انتشار بسته	3.fc38
معماری بسته	x86_64
نگهدارنده	-
تاریخ ساخت	Sun 22 Jan 2023 12
هاست سازنده	buildvm-x86-08.iad2.fedoraproject.org
نوع بسته	.rpm
آدرس صفحه اصلی	https://CRAN.R-project.org/package=ape
مجوز	GPL-2.0-only or GPL-3.0-only
حجم دانلود	3.4M
حجم نصب	4.412M

Functions for reading, writing, plotting, and manipulating phylogenetic trees, analyses of comparative data in a phylogenetic framework, ancestral character analyses, analyses of diversification and macroevolution, computing distances from DNA sequences, reading and writing nucleotide sequences as well as importing from BioConductor, and several tools such as Mantel's test, generalized skyline plots, graphical exploration of phylogenetic data (alex, trex, kronoviz), estimation of absolute evolutionary rates and clock-like trees using mean path lengths and penalized likelihood, dating trees with non-contemporaneous sequences, translating DNA into AA sequences, and assessing sequence alignments. Phylogeny estimation can be done with the NJ, BIONJ, ME, MVR, SDM, and triangle methods, and several methods handling incomplete distance matrices (NJ*, BIONJ*, MVR*, and the corresponding triangle method). Some functions call external applications (PhyML, Clustal, T-Coffee, Muscle) whose results are returned into R.

جایگزین ها

بسته	نسخه	معماری	مخزن
R-ape-5.6.2-3.fc38.aarch64.rpm	5.6.2	aarch64	Fedora Everything
R-ape-5.6.2-3.fc38.src.rpm	5.6.2	x86_64	Fedora Everything
R-ape-5.7.1-2.fc38.aarch64.rpm	5.7.1	aarch64	Fedora Everything
R-ape-5.7.1-2.fc38.src.rpm	5.7.1	x86_64	Fedora Everything
R-ape-5.7.1-2.fc38.x86_64.rpm	5.7.1	x86_64	Fedora Everything
R-ape-debuginfo-5.6.2-3.fc38.aarch64.rpm	5.6.2	aarch64	Fedora Everything
R-ape-debuginfo-5.6.2-3.fc38.x86_64.rpm	5.6.2	x86_64	Fedora Everything
R-ape-debuginfo-5.7.1-2.fc38.aarch64.rpm	5.7.1	aarch64	Fedora Everything
R-ape-debuginfo-5.7.1-2.fc38.x86_64.rpm	5.7.1	x86_64	Fedora Everything
R-ape-debugsource-5.6.2-3.fc38.aarch64.rpm	5.6.2	aarch64	Fedora Everything
R-ape-debugsource-5.6.2-3.fc38.x86_64.rpm	5.6.2	x86_64	Fedora Everything
R-ape-debugsource-5.7.1-2.fc38.aarch64.rpm	5.7.1	aarch64	Fedora Everything
R-ape-debugsource-5.7.1-2.fc38.x86_64.rpm	5.7.1	x86_64	Fedora Everything

نیازمندی

مقدار	نام
= 4.2	R(ABI)
>= 0.12.0	R(Rcpp)
-	R(graphics)
-	R(lattice)
-	R(methods)
-	R(nlme)
-	R(parallel)
-	R(stats)
-	R(tools)
-	R(utils)
>= 3.2.0	R-core
-	libR.so()(64bit)
-	libc.so.6()(64bit)
-	libc.so.6(GLIBC_2.14)(64bit)
-	libc.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)
-	libc.so.6(GLIBC_2.3.4)(64bit)
-	libc.so.6(GLIBC_2.4)(64bit)
-	libflexiblas.so.3()(64bit)
-	libgcc_s.so.1()(64bit)
-	libgcc_s.so.1(GCC_3.0)(64bit)
-	libm.so.6()(64bit)
-	libm.so.6(GLIBC_2.2.5)(64bit)
-	libm.so.6(GLIBC_2.29)(64bit)
-	libstdc++.so.6()(64bit)
-	libstdc++.so.6(CXXABI_1.3)(64bit)
-	libstdc++.so.6(CXXABI_1.3.9)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.11)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.20)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.21)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.29)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.30)(64bit)
-	libstdc++.so.6(GLIBCXX_3.4.9)(64bit)
-	rtld(GNU_HASH)

ارائه دهنده

مقدار	نام
= 5.6.2	R(ape)
= 5.6.2-3.fc38	R-ape
= 5.6.2-3.fc38	R-ape(x86-64)

نحوه نصب

نصب پکیج rpm R-ape:

dnf install R-ape-5.6.2-3.fc38.x86_64.rpm

فایل ها

مسیرها
/usr/lib/.build-id
/usr/lib/.build-id/7d
/usr/lib/.build-id/7d/43329b447d062aaf91dbca27a580d051689afa
/usr/lib64/R/library/ape
/usr/lib64/R/library/ape/CITATION
/usr/lib64/R/library/ape/DESCRIPTION
/usr/lib64/R/library/ape/INDEX
/usr/lib64/R/library/ape/Meta
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/Rd.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/data.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/features.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/hsearch.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/links.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/nsInfo.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/package.rds
/usr/lib64/R/library/ape/Meta/vignette.rds
/usr/lib64/R/library/ape/NAMESPACE
/usr/lib64/R/library/ape/NEWS
/usr/lib64/R/library/ape/R
/usr/lib64/R/library/ape/R/ape
/usr/lib64/R/library/ape/R/ape.rdb
/usr/lib64/R/library/ape/R/ape.rdx
/usr/lib64/R/library/ape/data
/usr/lib64/R/library/ape/data/HP.links.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/bird.families.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/bird.orders.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/carnivora.csv.gz
/usr/lib64/R/library/ape/data/chiroptera.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/cynipids.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/gopher.D.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/hivtree.newick.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/hivtree.table.txt.gz
/usr/lib64/R/library/ape/data/lice.D.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/lmorigin.ex1.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/lmorigin.ex2.rda
/usr/lib64/R/library/ape/data/mat3.RData
/usr/lib64/R/library/ape/data/mat5M3ID.RData
/usr/lib64/R/library/ape/data/mat5Mrand.RData
/usr/lib64/R/library/ape/data/woodmouse.rda
/usr/lib64/R/library/ape/doc
/usr/lib64/R/library/ape/doc/DrawingPhylogenies.R
/usr/lib64/R/library/ape/doc/DrawingPhylogenies.Rnw
/usr/lib64/R/library/ape/doc/DrawingPhylogenies.pdf
/usr/lib64/R/library/ape/doc/MoranI.R
/usr/lib64/R/library/ape/doc/MoranI.Rnw
/usr/lib64/R/library/ape/doc/MoranI.pdf
/usr/lib64/R/library/ape/doc/RandomTopologies.R
/usr/lib64/R/library/ape/doc/RandomTopologies.Rnw
/usr/lib64/R/library/ape/doc/RandomTopologies.pdf
/usr/lib64/R/library/ape/doc/index.html
... and 654 more

گزارش تغییرات

تاریخ آخرین تغییر	جزئیات
2023-01-22	Drop support for i686 Switch to SPDX licenses
2023-01-18	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_38_Mass_Rebuild
2022-09-02	update to 5.6-2 rebuild for R 4.2.1 bootstrap on
2022-07-20	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_37_Mass_Rebuild
2022-01-19	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_36_Mass_Rebuild
2021-07-21	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_35_Mass_Rebuild
2021-06-17	bootstrap off, but rework check logic around missing phangorn
2021-06-15	update to 5.5 bootstrap Rebuilt for R 4.1.0
2021-06-07	rebuild for R 4.1.0
2021-01-25	Rebuilt for https://fedoraproject.org/wiki/Fedora_34_Mass_Rebuild